188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2049 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  100 
 
 		 325 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  27.27 
 
 		 300 aa  113  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  29.97 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  28.21 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  29.22 
 
 		 334 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  27.64 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  28.4 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.248516 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  29.75 
 
 		 375 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  26.88 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  28.99 
 
 		 321 aa  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  27.13 
 
 		 323 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  28.1 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  28.1 
 
 		 334 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  28.79 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  27.35 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  28.65 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  28.7 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  27.02 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  28.47 
 
 		 324 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  28.47 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3741  cytoskeletal protein RodZ  28.57 
 
 		 337 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  28.07 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  28.57 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  28.57 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  28.57 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  28.57 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  28.57 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  31.74 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  28.61 
 
 		 334 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  27.95 
 
 		 361 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  27.95 
 
 		 361 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  28.57 
 
 		 337 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  27.79 
 
 		 380 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  27.27 
 
 		 327 aa  96.7  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  26.74 
 
 		 345 aa  96.3  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  26.46 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  28.74 
 
 		 361 aa  92  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  29.57 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  30.19 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  25 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  28.82 
 
 		 360 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  26.27 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  25.39 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  30.12 
 
 		 286 aa  87  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  24.44 
 
 		 363 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  30.12 
 
 		 286 aa  87  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  28.24 
 
 		 360 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  27.24 
 
 		 291 aa  85.9  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  24.12 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  26.93 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3127  XRE family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  24.11 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  27.74 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  26.17 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  26.03 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  29.74 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  26.05 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  27.59 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1543  hypothetical protein  26.1 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0277008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  21.1 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3391  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1714  hypothetical protein  26.42 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333106  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  23.69 
 
 		 364 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1778  hypothetical protein  26.18 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842722  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  32.06 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  32.06 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0734  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 404 aa  72.8  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  22.73 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  32.61 
 
 		 210 aa  68.9  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  32.61 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.46 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  28.18 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2308  hypothetical protein  25.87 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318236  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  24.19 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  24.31 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  26.8 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4326  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137482  hitchhiker  0.0000000466309 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  27.89 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  41.98 
 
 		 367 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  21.26 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  41.43 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  40 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0895  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000331112 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0624  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1903  heat shock protein DnaJ-like  41.18 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2061  heat shock protein DnaJ domain protein  41.18 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  26.47 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1976  heat shock protein DnaJ domain protein  41.18 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  23.94 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  28.8 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  35.21 
 
 		 441 aa  56.2  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  43.66 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  35.44 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  35.44 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>