More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2831 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  100 
 
 		 485 aa  942    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  48.08 
 
 		 457 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  43.01 
 
 		 678 aa  368  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  43.93 
 
 		 506 aa  362  6e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  44.31 
 
 		 512 aa  356  5e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 		 494 aa  354  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  46.08 
 
 		 492 aa  352  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  40.73 
 
 		 523 aa  344  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  44.09 
 
 		 650 aa  332  8e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  41.42 
 
 		 643 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  41.42 
 
 		 643 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  41.42 
 
 		 643 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  42.28 
 
 		 487 aa  331  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  45.13 
 
 		 482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  40.18 
 
 		 499 aa  316  7e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  36.67 
 
 		 503 aa  301  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  38.3 
 
 		 492 aa  301  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 517 aa  299  9e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  43.35 
 
 		 504 aa  295  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  39.46 
 
 		 494 aa  293  6e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  38.76 
 
 		 480 aa  292  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  40.48 
 
 		 476 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  41.9 
 
 		 484 aa  264  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  37.32 
 
 		 491 aa  256  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 488 aa  232  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  39.41 
 
 		 482 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.65 
 
 		 449 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  37.91 
 
 		 474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  33.12 
 
 		 487 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 477 aa  209  6e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  34.61 
 
 		 485 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 		 498 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 548 aa  207  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 471 aa  203  4e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  33.47 
 
 		 489 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  33.75 
 
 		 484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  34.9 
 
 		 487 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  34.9 
 
 		 487 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 487 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2371  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 		 472 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130486  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 		 474 aa  178  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 475 aa  177  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 487 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 473 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  35.12 
 
 		 500 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 473 aa  171  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  28.17 
 
 		 477 aa  164  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 464 aa  161  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 470 aa  160  5e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 502 aa  152  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  33.83 
 
 		 483 aa  152  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2303  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.44 
 
 		 474 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.95 
 
 		 524 aa  143  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2370  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 474 aa  139  8.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.9 
 
 		 592 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.29 
 
 		 535 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.13 
 
 		 504 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.41 
 
 		 510 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.78 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.67 
 
 		 478 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 491 aa  138  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.4 
 
 		 511 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.03 
 
 		 508 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.84 
 
 		 513 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1328  multidrug resistance protein B  28.27 
 
 		 511 aa  134  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.307872  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.6 
 
 		 513 aa  133  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.6 
 
 		 513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.02 
 
 		 511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.41 
 
 		 513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  23.41 
 
 		 513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.41 
 
 		 513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  23.41 
 
 		 513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.73 
 
 		 513 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.41 
 
 		 513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.73 
 
 		 513 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.03 
 
 		 621 aa  131  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.54 
 
 		 478 aa  131  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.24 
 
 		 477 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.8 
 
 		 511 aa  130  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.41 
 
 		 475 aa  130  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.92 
 
 		 511 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.92 
 
 		 511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.92 
 
 		 511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.83 
 
 		 475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  25.92 
 
 		 511 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.27 
 
 		 530 aa  129  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.78 
 
 		 522 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  25.92 
 
 		 511 aa  127  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.02 
 
 		 525 aa  127  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0759  major facilitator superfamily permease  26.43 
 
 		 554 aa  126  7e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000977825  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4580  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 473 aa  126  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.19 
 
 		 569 aa  126  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  26.37 
 
 		 522 aa  126  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.13 
 
 		 646 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.86 
 
 		 534 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.13 
 
 		 646 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>