242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1000 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  100 
 
 		 416 aa  839    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  57.83 
 
 		 411 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  50.47 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  49.37 
 
 		 416 aa  350  4e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  46.56 
 
 		 419 aa  329  7e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  45.89 
 
 		 416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  44.72 
 
 		 423 aa  306  6e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  43.33 
 
 		 430 aa  300  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  42.82 
 
 		 429 aa  298  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  46.94 
 
 		 418 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  44.32 
 
 		 449 aa  290  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  42.68 
 
 		 416 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  41.47 
 
 		 429 aa  280  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  43.07 
 
 		 416 aa  279  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  42.68 
 
 		 416 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  42.68 
 
 		 416 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  42.42 
 
 		 416 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  42.42 
 
 		 416 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  41.39 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  43.57 
 
 		 410 aa  275  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  41.29 
 
 		 407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  42.62 
 
 		 412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  47.7 
 
 		 405 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  42.71 
 
 		 411 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  41.15 
 
 		 408 aa  272  8.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  46.36 
 
 		 416 aa  272  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  42.9 
 
 		 412 aa  269  8e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  43.02 
 
 		 425 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  39.19 
 
 		 408 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  37.1 
 
 		 404 aa  222  9e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  37.37 
 
 		 416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  37.56 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  33.82 
 
 		 410 aa  212  9e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  36.36 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  36.11 
 
 		 422 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  37.83 
 
 		 418 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  37.76 
 
 		 418 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  31.04 
 
 		 436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  29.56 
 
 		 413 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  29.75 
 
 		 422 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  31.8 
 
 		 432 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  32.09 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  31.45 
 
 		 413 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  30.85 
 
 		 413 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  31.1 
 
 		 413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  31.1 
 
 		 413 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  31.45 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  31.1 
 
 		 432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  30.74 
 
 		 432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  31.1 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.63 
 
 		 465 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  31.21 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  32.63 
 
 		 394 aa  156  7e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  31.58 
 
 		 420 aa  149  7e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  31 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  29.97 
 
 		 420 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  32.77 
 
 		 398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  30.39 
 
 		 448 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  35.15 
 
 		 464 aa  139  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  30.67 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  30.67 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  29.84 
 
 		 413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  32.67 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  25.19 
 
 		 435 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  30.35 
 
 		 513 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  30.77 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.87 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  27.87 
 
 		 379 aa  106  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  33.33 
 
 		 376 aa  94  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0828  metallophosphoesterase  28.45 
 
 		 428 aa  90.9  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  30.42 
 
 		 368 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  26.16 
 
 		 434 aa  87.8  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  32.11 
 
 		 376 aa  87  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  27.02 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  28.07 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  20.11 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  26.69 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  28.39 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  24.5 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  23.4 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  25.29 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  27.54 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  29.87 
 
 		 418 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  28.94 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  22.41 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  29.43 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  25.84 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  24.53 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  30 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  28.27 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.1 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  30 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  36.08 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  27.41 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  28.19 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  29.35 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  26.28 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  27.86 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  23.35 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  36.46 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>