More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0311 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0311  OmpA/MotB  100 
 
 
246 aa  493  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  37.29 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  34.58 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  40.59 
 
 
402 aa  74.3  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  35.96 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  31.82 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  33.64 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  36.89 
 
 
890 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  35.04 
 
 
658 aa  72.8  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.36 
 
 
609 aa  72.4  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  33.94 
 
 
214 aa  72  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 
490 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  34.55 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  33.04 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  34.82 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  37.27 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  33.04 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  35.45 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  35.34 
 
 
499 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  35.45 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  31.82 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  35.51 
 
 
505 aa  70.1  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  32.41 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  32.11 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  37 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 
458 aa  68.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  34.95 
 
 
459 aa  69.3  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  34.82 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  35.45 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  34.58 
 
 
617 aa  68.9  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
361 aa  68.9  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  34.86 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.04 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  31.58 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.92 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  35.92 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  30.97 
 
 
218 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  32.61 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  37.86 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  35.92 
 
 
310 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  33.98 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  36.94 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  35.92 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  35.92 
 
 
310 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  35.92 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  36.94 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 
642 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  40.28 
 
 
1264 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  39.56 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  35.92 
 
 
310 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  29.63 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  35.92 
 
 
310 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  34.82 
 
 
231 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  34.23 
 
 
216 aa  67  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  34.95 
 
 
316 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  35.92 
 
 
311 aa  67  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  34.23 
 
 
216 aa  67  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  33.03 
 
 
224 aa  67  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  32.38 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  34.4 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  35.51 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  35.58 
 
 
620 aa  66.2  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  35.92 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  34.95 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 
1755 aa  65.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  31.82 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  34.21 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  33.65 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  34.95 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  31.82 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  30.91 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  25.82 
 
 
537 aa  65.9  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  28.7 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  34.23 
 
 
638 aa  65.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  30 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  32.04 
 
 
537 aa  65.5  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  29.66 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  36.94 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  31.25 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  34.38 
 
 
525 aa  65.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  31.25 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  32.5 
 
 
242 aa  65.1  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  32.04 
 
 
707 aa  65.1  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  32.04 
 
 
440 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  29.45 
 
 
209 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  34.19 
 
 
292 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  34.58 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  36.94 
 
 
256 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  33.59 
 
 
525 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 
288 aa  64.7  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  28.23 
 
 
653 aa  65.1  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  37.14 
 
 
239 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  30.3 
 
 
656 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  31.78 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>