More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3406 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 290 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  58.21 
 
 		 276 aa  295  8e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  56.16 
 
 		 281 aa  279  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  52.82 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  51.11 
 
 		 348 aa  244  9e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  46.32 
 
 		 313 aa  242  6e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  49.47 
 
 		 293 aa  242  7e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  51.69 
 
 		 311 aa  240  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  47.15 
 
 		 368 aa  232  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  50.37 
 
 		 277 aa  228  9e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  48.35 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  49.82 
 
 		 287 aa  219  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  47.14 
 
 		 284 aa  219  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  49.1 
 
 		 352 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  47.96 
 
 		 441 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  46.05 
 
 		 308 aa  215  9e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  45.65 
 
 		 339 aa  209  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  46.3 
 
 		 289 aa  207  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 484 aa  202  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  41.43 
 
 		 292 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  40.75 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  41.44 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  46.49 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  41.43 
 
 		 296 aa  188  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  47.84 
 
 		 403 aa  186  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  41.05 
 
 		 301 aa  185  9e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  42.05 
 
 		 291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  40.14 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  41.16 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  39.01 
 
 		 284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  39.01 
 
 		 284 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  39.01 
 
 		 284 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  42.66 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  35.09 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  36.08 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  30.82 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  39.34 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  30.41 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  45.52 
 
 		 279 aa  119  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  41.51 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  46 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.76 
 
 		 475 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  43.97 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  38.54 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  43.66 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  46.32 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  44.35 
 
 		 280 aa  105  8e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  41.18 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  47.9 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  48.28 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  42.95 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  37.69 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  46.03 
 
 		 318 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  39.39 
 
 		 298 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  30.33 
 
 		 261 aa  102  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  42.52 
 
 		 268 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  31.8 
 
 		 258 aa  102  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  31.56 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  41.14 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  43.57 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  49.22 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  38 
 
 		 260 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  49.58 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  36.67 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  47.54 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 		 271 aa  99.8  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  51.67 
 
 		 278 aa  99.8  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  35.05 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  38.97 
 
 		 287 aa  99.4  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  40.74 
 
 		 310 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  35.37 
 
 		 260 aa  99.4  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  46.28 
 
 		 293 aa  99  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  35.37 
 
 		 260 aa  99.4  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  30.37 
 
 		 296 aa  99  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  35.8 
 
 		 260 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  39.2 
 
 		 261 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  43.86 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  46.72 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  41.26 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  32.8 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  33.73 
 
 		 252 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  38.95 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  36.32 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0293  phosphatidate cytidylyltransferase  40.99 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  39.24 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  49.11 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  36.57 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1922  phosphatidate cytidylyltransferase  38.28 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  39.58 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  44.29 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  40.97 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  27.43 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  41.73 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  39.58 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  40.97 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  40.97 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  40.97 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  45.69 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>