More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2862 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  100 
 
 		 542 aa  1093    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  67.16 
 
 		 532 aa  667    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  62.5 
 
 		 536 aa  655    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  62.84 
 
 		 540 aa  635    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  65.7 
 
 		 539 aa  660    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  75.61 
 
 		 662 aa  585  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  64.85 
 
 		 540 aa  561  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  69.92 
 
 		 792 aa  541  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  68.01 
 
 		 651 aa  529  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  47.97 
 
 		 521 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  46.78 
 
 		 703 aa  322  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  35.08 
 
 		 559 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  39.44 
 
 		 652 aa  253  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  39.8 
 
 		 430 aa  243  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  37.7 
 
 		 762 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  36.52 
 
 		 1271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  35.93 
 
 		 425 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  34.57 
 
 		 854 aa  196  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  32.11 
 
 		 439 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  33.58 
 
 		 400 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  33.74 
 
 		 451 aa  188  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  33.75 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  34.15 
 
 		 414 aa  188  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  34.85 
 
 		 586 aa  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1080 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  35.1 
 
 		 472 aa  181  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  31.31 
 
 		 674 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  31.31 
 
 		 674 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  31.31 
 
 		 674 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  31.08 
 
 		 674 aa  179  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  30.96 
 
 		 674 aa  178  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  31.53 
 
 		 674 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  31.08 
 
 		 674 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  31.31 
 
 		 674 aa  177  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  31.08 
 
 		 674 aa  176  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  31.08 
 
 		 674 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  33.33 
 
 		 763 aa  174  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  30.63 
 
 		 674 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  33.25 
 
 		 484 aa  169  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  26.92 
 
 		 869 aa  161  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  29.63 
 
 		 639 aa  161  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  28.32 
 
 		 868 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  31.81 
 
 		 482 aa  160  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  33.85 
 
 		 398 aa  159  9e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  27.61 
 
 		 867 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  27.42 
 
 		 868 aa  159  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  27.37 
 
 		 868 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  26.98 
 
 		 868 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  29.89 
 
 		 848 aa  156  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  27.46 
 
 		 868 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  27.1 
 
 		 868 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  29.66 
 
 		 855 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  31.59 
 
 		 652 aa  154  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  30.05 
 
 		 675 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  29.81 
 
 		 863 aa  148  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  28.78 
 
 		 563 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  29.21 
 
 		 848 aa  147  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  28.12 
 
 		 972 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  31.52 
 
 		 373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  28.54 
 
 		 463 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  29.08 
 
 		 505 aa  124  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  30.16 
 
 		 1362 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  30.72 
 
 		 431 aa  121  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  28.72 
 
 		 396 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  29.06 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  26.93 
 
 		 407 aa  115  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  29.97 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  30.92 
 
 		 366 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  26.6 
 
 		 372 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  43.26 
 
 		 613 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  30.37 
 
 		 377 aa  109  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  26.89 
 
 		 499 aa  108  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  56.52 
 
 		 459 aa  107  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  30.65 
 
 		 465 aa  107  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  29.01 
 
 		 1578 aa  104  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  31.46 
 
 		 468 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  52.69 
 
 		 462 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  46.09 
 
 		 507 aa  100  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  47.2 
 
 		 552 aa  100  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  26.51 
 
 		 1782 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  24.94 
 
 		 657 aa  97.8  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  42.75 
 
 		 467 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  28.22 
 
 		 382 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  27.86 
 
 		 1146 aa  94.7  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  28.61 
 
 		 861 aa  94.4  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  40.58 
 
 		 539 aa  94.4  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  26.86 
 
 		 364 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  29.48 
 
 		 997 aa  91.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 		 1127 aa  90.9  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  27.1 
 
 		 772 aa  90.5  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  27.03 
 
 		 1127 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  27.03 
 
 		 1127 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  23.81 
 
 		 634 aa  89  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  26.28 
 
 		 904 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  25.43 
 
 		 1132 aa  87.8  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  26.55 
 
 		 1127 aa  87.8  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 355 aa  87.4  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  44.26 
 
 		 2310 aa  87  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  23.36 
 
 		 1443 aa  86.7  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  43.56 
 
 		 514 aa  85.9  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>