More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1050 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1050  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
253 aa  513  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.150046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.97 
 
 
260 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379733  normal  0.717658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.16 
 
 
260 aa  357  9.999999999999999e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.76 
 
 
258 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 
255 aa  292  4e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000026464  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.77 
 
 
255 aa  285  7e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.157032 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.77 
 
 
255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.04 
 
 
257 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.97 
 
 
263 aa  270  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.993819  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.35 
 
 
257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05637  short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_4G13550)  50.39 
 
 
262 aa  263  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.35699  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.96 
 
 
284 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.72 
 
 
256 aa  256  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.57 
 
 
284 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.57 
 
 
284 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10306  predicted protein  51.97 
 
 
267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275208  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.15 
 
 
269 aa  251  8.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490392  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.38 
 
 
259 aa  250  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.21 
 
 
256 aa  248  8e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.54 
 
 
268 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0330322 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.3 
 
 
268 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal  0.73895 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52 
 
 
267 aa  244  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.425244  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.4 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0083213  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.55 
 
 
267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.223679  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20270  beta-ketoacyl reductase  49.6 
 
 
256 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.483952 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.08 
 
 
268 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
257 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.105018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5272  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.9 
 
 
268 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1187  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.81 
 
 
256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.206395 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.76 
 
 
256 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02410  conserved hypothetical protein  46.06 
 
 
264 aa  221  7e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.167898  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
258 aa  221  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0751  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR)  52.55 
 
 
269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00784  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_1G14540)  42.86 
 
 
281 aa  195  6e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2403  gluconate 5-dehydrogenase  44.14 
 
 
258 aa  186  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.525317  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1409  gluconate 5-dehydrogenase  41.8 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
257 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1851  gluconate 5-dehydrogenase  42.41 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2919  gluconate 5-dehydrogenase  41.18 
 
 
264 aa  172  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  40.7 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1484  gluconate 5-dehydrogenase  38.67 
 
 
260 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0155973  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1443  gluconate 5-dehydrogenase  38.67 
 
 
260 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325951  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
257 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0441783  normal  0.700268 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  38.67 
 
 
259 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 
252 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2873  gluconate 5-dehydrogenase  39.61 
 
 
263 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1763  gluconate 5-dehydrogenase  38.28 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.401808  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2493  gluconate 5-dehydrogenase  40.31 
 
 
274 aa  166  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
252 aa  166  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1844  gluconate 5-dehydrogenase  38.76 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250447  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2306  gluconate 5-dehydrogenase  41.15 
 
 
262 aa  162  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833457 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
254 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2353  gluconate 5-dehydrogenase  40.47 
 
 
262 aa  161  8.000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  36.36 
 
 
260 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
264 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
254 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61314  peroxisomal 2,4- dienoyl-CoA reductase  37.79 
 
 
269 aa  159  6e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35804  normal  0.723211 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
257 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
257 aa  158  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16609  predicted protein  46.46 
 
 
266 aa  157  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
247 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.991587  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5273  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.98 
 
 
260 aa  156  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3360  gluconate 5-dehydrogenase  39.92 
 
 
263 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.319469  normal  0.757652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4004  gluconate 5-dehydrogenase  38.91 
 
 
267 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
259 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
266 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2008  gluconate 5-dehydrogenase  39.61 
 
 
263 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1695  gluconate 5-dehydrogenase  39.61 
 
 
263 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  38.13 
 
 
254 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06274  short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_7G04540)  38.13 
 
 
345 aa  151  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0418357  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
255 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
266 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
258 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.063344  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2389  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.3 
 
 
255 aa  149  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
257 aa  149  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000174096  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  37.98 
 
 
257 aa  149  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  33.86 
 
 
254 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
252 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  37.74 
 
 
254 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  38.19 
 
 
257 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  37.21 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  36.58 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 
254 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  34.25 
 
 
267 aa  145  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
247 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2801  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.98 
 
 
249 aa  144  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  36.96 
 
 
254 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
247 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
257 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  37.74 
 
 
254 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>