More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0562 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  100 
 
 
340 aa  671    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  56.4 
 
 
343 aa  384  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2115  inner-membrane translocator  55.32 
 
 
353 aa  372  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  34.29 
 
 
357 aa  200  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  37.01 
 
 
362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  38.14 
 
 
365 aa  196  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  33.76 
 
 
352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  35.76 
 
 
391 aa  183  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  34.62 
 
 
357 aa  179  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  34.44 
 
 
371 aa  179  9e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  36.88 
 
 
371 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  35.33 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  37.7 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  37.92 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  34.8 
 
 
344 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  34.8 
 
 
344 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  38.2 
 
 
356 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  35.37 
 
 
360 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  37.38 
 
 
373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  34.48 
 
 
338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  31.4 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  31.29 
 
 
365 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.33 
 
 
381 aa  163  3e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.47 
 
 
355 aa  162  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  35.81 
 
 
347 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  29.82 
 
 
365 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  32.66 
 
 
367 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  34.49 
 
 
365 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  30.95 
 
 
373 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  32.98 
 
 
364 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  33.67 
 
 
347 aa  149  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  35.97 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  31.96 
 
 
442 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  30.46 
 
 
372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  33.94 
 
 
347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.29 
 
 
349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  30.86 
 
 
352 aa  146  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  35.2 
 
 
349 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  33.62 
 
 
354 aa  145  8.000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  33.62 
 
 
354 aa  145  8.000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  34.87 
 
 
349 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  34.48 
 
 
358 aa  143  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  33.01 
 
 
427 aa  143  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  31.71 
 
 
451 aa  142  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  31.56 
 
 
352 aa  142  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  31.56 
 
 
352 aa  142  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  29.97 
 
 
365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  31.45 
 
 
352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.94 
 
 
347 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  29.6 
 
 
359 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  31.75 
 
 
349 aa  138  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  28.92 
 
 
357 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0956  sugar ABC transporter, permease protein, putative  31.96 
 
 
353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281596  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.03 
 
 
471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4193  inner-membrane translocator  33.76 
 
 
375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  32.6 
 
 
365 aa  136  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  32.92 
 
 
349 aa  135  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  33.64 
 
 
347 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  31.75 
 
 
454 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  31.16 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  31.16 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  35.24 
 
 
370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  31.16 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0917  inner-membrane translocator  28.31 
 
 
351 aa  134  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  33.44 
 
 
426 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  31.16 
 
 
352 aa  133  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  35.26 
 
 
349 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  31.16 
 
 
352 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.03 
 
 
364 aa  132  6.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.48 
 
 
355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  28.45 
 
 
366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  27.57 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  31.46 
 
 
363 aa  130  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  32.8 
 
 
349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  32.1 
 
 
437 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  28.15 
 
 
366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  28.84 
 
 
355 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  29.66 
 
 
462 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  33.64 
 
 
408 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  33.01 
 
 
365 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6252  inner-membrane translocator  31.89 
 
 
339 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7968 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  32.17 
 
 
360 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  29.66 
 
 
417 aa  123  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4143  inner-membrane translocator  28.75 
 
 
382 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5657  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  31.42 
 
 
392 aa  122  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.348277  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.11 
 
 
360 aa  122  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  30.95 
 
 
365 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  29.78 
 
 
369 aa  120  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  30.42 
 
 
414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  29.65 
 
 
369 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  29 
 
 
388 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  29.29 
 
 
364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  28.97 
 
 
369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  28.74 
 
 
354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  29 
 
 
354 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  30.58 
 
 
419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  25.55 
 
 
383 aa  116  6e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  30.77 
 
 
364 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0474  inner-membrane translocator  28.18 
 
 
334 aa  115  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000000132511  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  29.64 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>