More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0548 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0548  response regulator receiver and Hpt phospho transfer protein  100 
 
 
570 aa  1143    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  29.67 
 
 
982 aa  94.7  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 
1692 aa  92.4  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1943  histidine kinase  35.96 
 
 
647 aa  90.5  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.539019  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.9 
 
 
1442 aa  89.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 
1266 aa  89.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1012  response regulator, histidine kinase  42.11 
 
 
578 aa  88.6  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  39.16 
 
 
925 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 
936 aa  87  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  39.16 
 
 
925 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0671  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
857 aa  87  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269812 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 
2423 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.61 
 
 
974 aa  86.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0515999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  38.33 
 
 
1987 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  33.82 
 
 
676 aa  85.9  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 
631 aa  85.5  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.97 
 
 
763 aa  85.1  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 
770 aa  84.7  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 
1240 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.39 
 
 
929 aa  84.3  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  45.63 
 
 
246 aa  84  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  37.5 
 
 
1992 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  36.51 
 
 
1023 aa  83.2  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2818  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
720 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.215558  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  27.54 
 
 
497 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003159  probable sensor/response regulator hybrid  38.94 
 
 
566 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  39.44 
 
 
772 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  26.14 
 
 
932 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0688  histidine kinase  36.13 
 
 
691 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.28 
 
 
932 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  40.68 
 
 
2301 aa  82.8  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2502  sensor histidine kinase/response regulator  39.13 
 
 
676 aa  82  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000989132  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3018  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.07 
 
 
955 aa  81.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0433784  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  28 
 
 
1042 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01913  signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 
526 aa  81.3  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 
643 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  29.06 
 
 
1560 aa  80.9  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 
929 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1753  sensor protein LuxQ  38.33 
 
 
583 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.042622 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 
990 aa  80.5  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  32.16 
 
 
564 aa  80.5  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
1647 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.28 
 
 
717 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02766  histidine kinase  35.34 
 
 
849 aa  80.5  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0460  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  40 
 
 
835 aa  80.1  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.980587  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  31.08 
 
 
2035 aa  79.7  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 
643 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  30.57 
 
 
833 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 
778 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 
835 aa  80.1  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.63 
 
 
876 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2180  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 
922 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.238731  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0100  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 
1182 aa  79.7  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73542  histidine kinase osmosensor  38.71 
 
 
1118 aa  80.1  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  38.35 
 
 
742 aa  79  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0924  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
701 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.19 
 
 
933 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2833  histidine kinase  35.04 
 
 
576 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535084 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 
2539 aa  79.3  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.35 
 
 
1499 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3268  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  35.9 
 
 
957 aa  79  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00176531  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 
1222 aa  79.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4576  histidine kinase  40.34 
 
 
678 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.354871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  33.97 
 
 
905 aa  79  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003077  autoinducer 1 sensor kinase/phosphatase luxN  36.75 
 
 
846 aa  79  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  45.1 
 
 
229 aa  78.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1040  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.87 
 
 
934 aa  78.6  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301921  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  41.07 
 
 
2284 aa  78.6  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  42.97 
 
 
582 aa  78.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.64 
 
 
969 aa  78.6  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.44 
 
 
1121 aa  78.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1769  response regulator receiver protein, CheY  35.83 
 
 
151 aa  78.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2521  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.26 
 
 
597 aa  78.6  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 
1131 aa  78.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  47.12 
 
 
234 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
1646 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 
1791 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  25.32 
 
 
1042 aa  78.2  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
1646 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2179  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.52 
 
 
575 aa  78.2  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.69 
 
 
1016 aa  78.2  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  36 
 
 
1135 aa  77.8  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  37.78 
 
 
977 aa  78.2  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 
1002 aa  77.8  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  42.15 
 
 
1177 aa  77.8  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.74 
 
 
738 aa  77.8  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 
922 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02306  hypothetical protein  26.45 
 
 
576 aa  77.8  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4228  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1011 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  35.85 
 
 
620 aa  77.4  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  38.83 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  38.83 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 
1044 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 
1033 aa  77.4  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  44.55 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 
864 aa  77.4  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
1629 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  39.81 
 
 
241 aa  77  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>