136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2778 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2778  PspC domain-containing protein  100 
 
 		 77 aa  153  9e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000150595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  55.17 
 
 		 58 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  48.28 
 
 		 61 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  51.72 
 
 		 240 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  48.28 
 
 		 61 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  51.79 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  48.33 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  57.14 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  56.14 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  46.75 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  44.83 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  44.83 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  46.97 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  49.3 
 
 		 82 aa  63.5  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  41.43 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  48.21 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  46.55 
 
 		 61 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  46.55 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  46.55 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  46.55 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  46.55 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  46.55 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  46.88 
 
 		 68 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3206  phage shock protein C, PspC  46.55 
 
 		 61 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.849771  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  39.68 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 165 aa  60.1  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  44 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  43.66 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  53.52 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  36.62 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  42.86 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  42.37 
 
 		 86 aa  57  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  35.29 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  32.84 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  41.56 
 
 		 346 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  34.15 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  44.07 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  39.66 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 398 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  36.71 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2286  hypothetical protein  39.68 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0202  phage shock protein C, PspC  45.83 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.183382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 62 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2440  phage shock protein C, PspC  48.28 
 
 		 66 aa  50.1  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3224  phage shock protein C, PspC  48.21 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1319  phage shock protein C, PspC  39.53 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0768012  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1634  phage shock protein C, PspC  38.89 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000119138  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  37.29 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  35.71 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1982  phage shock protein C, PspC  38.1 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161663  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  40.38 
 
 		 512 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  40.68 
 
 		 515 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  41.18 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0686  phage shock protein C, PspC  41.3 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.920802  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 		 190 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00260  putative stress-responsive transcriptional regulator  41.27 
 
 		 248 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  40.82 
 
 		 547 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  32.79 
 
 		 419 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  37.5 
 
 		 555 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  36.23 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  37.29 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  36.67 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  40.35 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  35.82 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  34.78 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  34.78 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487796 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1239  phage shock protein C  37.5 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0689653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0542  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 578 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  32.88 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5231  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 		 474 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118703  hitchhiker  0.0028531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 847 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  40.74 
 
 		 416 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1616  phage shock protein C  39.22 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0788963  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  36.21 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  40.68 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  36.07 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1158  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  38.89 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  40.38 
 
 		 533 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  40.68 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6083  phage shock protein C, PspC  35.19 
 
 		 399 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  40.43 
 
 		 445 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  36.21 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1057  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.471359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>