More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1599 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 
574 aa  1162    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  45.77 
 
 
581 aa  561  1.0000000000000001e-159  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.14 
 
 
588 aa  551  1e-155  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  41.94 
 
 
577 aa  484  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  41.94 
 
 
577 aa  484  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  42.19 
 
 
588 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.1 
 
 
577 aa  457  1e-127  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  40.55 
 
 
577 aa  456  1e-127  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  38.54 
 
 
587 aa  455  1e-127  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  41.2 
 
 
574 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  40.65 
 
 
579 aa  449  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.17 
 
 
577 aa  447  1.0000000000000001e-124  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  40.14 
 
 
578 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  40.14 
 
 
578 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  41.6 
 
 
581 aa  438  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  40.37 
 
 
605 aa  422  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.42 
 
 
579 aa  420  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.73 
 
 
582 aa  411  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2008  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.56 
 
 
585 aa  408  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.91 
 
 
581 aa  399  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.79 
 
 
593 aa  362  1e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  39.43 
 
 
579 aa  347  5e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.65 
 
 
581 aa  332  2e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  32.29 
 
 
592 aa  322  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  35.91 
 
 
579 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  33.63 
 
 
576 aa  318  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  35.83 
 
 
581 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  34.12 
 
 
611 aa  316  7e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  36.57 
 
 
578 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  35.54 
 
 
590 aa  312  1e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  35.44 
 
 
581 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  36.36 
 
 
599 aa  307  3e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  35.36 
 
 
577 aa  306  6e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  32.26 
 
 
597 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  33.96 
 
 
592 aa  302  1e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  32.04 
 
 
593 aa  300  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  34.02 
 
 
577 aa  298  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  32.66 
 
 
604 aa  296  5e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.73 
 
 
581 aa  296  6e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  33.87 
 
 
593 aa  293  5e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.88 
 
 
574 aa  289  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.33 
 
 
573 aa  288  2e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.02 
 
 
595 aa  288  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  32.04 
 
 
602 aa  288  2e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.14 
 
 
618 aa  287  4e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  35.61 
 
 
595 aa  286  5.999999999999999e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  32.6 
 
 
579 aa  285  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  33.2 
 
 
596 aa  284  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.02 
 
 
585 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  34.46 
 
 
574 aa  282  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  30.83 
 
 
585 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.84 
 
 
575 aa  280  7e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  31.15 
 
 
581 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  31.34 
 
 
583 aa  277  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0676  ABC transporter related protein  34.89 
 
 
573 aa  277  4e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  30.17 
 
 
607 aa  277  4e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  33.27 
 
 
593 aa  277  5e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.64 
 
 
1091 aa  276  7e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.16 
 
 
597 aa  276  9e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0628  ABC transporter, ATP-binding protein  33.15 
 
 
573 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.484282  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.06 
 
 
572 aa  273  5.000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  32.38 
 
 
1228 aa  273  5.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.32 
 
 
576 aa  273  5.000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.2 
 
 
568 aa  273  7e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  32.55 
 
 
608 aa  273  9e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.81 
 
 
603 aa  272  1e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0353  ABC transporter related  36 
 
 
575 aa  272  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1491  ABC transporter related  33.79 
 
 
584 aa  271  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.72 
 
 
627 aa  271  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.26 
 
 
580 aa  271  2.9999999999999997e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  32.38 
 
 
587 aa  271  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  32.38 
 
 
587 aa  271  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.86 
 
 
583 aa  270  5.9999999999999995e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  31.47 
 
 
596 aa  269  8e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  30.92 
 
 
565 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0708  ABC transporter related  32.73 
 
 
573 aa  269  8.999999999999999e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153727  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.87 
 
 
581 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  32 
 
 
608 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0819  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.73 
 
 
578 aa  266  5e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608136  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.05 
 
 
580 aa  266  5.999999999999999e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  32.04 
 
 
598 aa  266  7e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.63 
 
 
596 aa  266  8.999999999999999e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2510  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.24 
 
 
577 aa  265  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  31.87 
 
 
580 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  30.89 
 
 
584 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  31.42 
 
 
610 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  31.11 
 
 
581 aa  264  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.35 
 
 
572 aa  264  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  32.51 
 
 
582 aa  264  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.28 
 
 
589 aa  264  4e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  31.12 
 
 
598 aa  263  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  31.75 
 
 
600 aa  262  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  32.92 
 
 
619 aa  261  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4419  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.91 
 
 
581 aa  262  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  30.69 
 
 
618 aa  261  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  32.34 
 
 
582 aa  261  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  31.99 
 
 
584 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  32.9 
 
 
579 aa  260  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  35.09 
 
 
578 aa  260  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  35.09 
 
 
578 aa  260  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>