More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0512 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0512  outer membrane protein, putative  100 
 
 		 792 aa  1615    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  26.98 
 
 		 765 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  26.51 
 
 		 752 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.51 
 
 		 808 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.94 
 
 		 802 aa  234  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  26.18 
 
 		 763 aa  234  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.52 
 
 		 763 aa  231  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1053  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.02 
 
 		 807 aa  226  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.69 
 
 		 895 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  25.49 
 
 		 769 aa  220  7.999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  25.54 
 
 		 751 aa  220  8.999999999999998e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.19 
 
 		 752 aa  203  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  25.42 
 
 		 888 aa  202  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.67 
 
 		 892 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.27 
 
 		 848 aa  184  8.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  24.68 
 
 		 893 aa  179  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  24.32 
 
 		 791 aa  178  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.74 
 
 		 785 aa  174  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.96 
 
 		 784 aa  171  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.93 
 
 		 772 aa  168  2.9999999999999998e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  23.07 
 
 		 905 aa  165  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  23.84 
 
 		 887 aa  164  8.000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  24.65 
 
 		 777 aa  163  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  22.84 
 
 		 820 aa  160  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  23.71 
 
 		 780 aa  160  9e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  25.08 
 
 		 782 aa  160  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.86 
 
 		 895 aa  160  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  22.46 
 
 		 913 aa  159  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  24.53 
 
 		 769 aa  159  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  24.53 
 
 		 768 aa  159  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  24.65 
 
 		 768 aa  159  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  24.53 
 
 		 768 aa  159  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.71 
 
 		 793 aa  159  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  24.53 
 
 		 768 aa  159  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  24.53 
 
 		 769 aa  158  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  24.53 
 
 		 769 aa  158  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  22.95 
 
 		 790 aa  158  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.15 
 
 		 803 aa  158  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.84 
 
 		 793 aa  157  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  24.4 
 
 		 768 aa  157  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  24.02 
 
 		 781 aa  157  8e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  24.43 
 
 		 770 aa  157  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  24.9 
 
 		 896 aa  156  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  23.62 
 
 		 785 aa  156  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  22.45 
 
 		 806 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  24.75 
 
 		 767 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.21 
 
 		 750 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  23.41 
 
 		 794 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.75 
 
 		 855 aa  152  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.22 
 
 		 821 aa  151  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.22 
 
 		 770 aa  151  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1574  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.06 
 
 		 786 aa  151  5e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.31 
 
 		 781 aa  150  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1751  surface antigen family protein  25.14 
 
 		 820 aa  150  7e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  23.07 
 
 		 788 aa  150  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.7 
 
 		 765 aa  150  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  22.7 
 
 		 765 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.41 
 
 		 769 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.76 
 
 		 787 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.63 
 
 		 920 aa  149  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.16 
 
 		 769 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.61 
 
 		 784 aa  148  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  24.22 
 
 		 769 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  24.22 
 
 		 769 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  23.35 
 
 		 778 aa  148  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.03 
 
 		 768 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  24.03 
 
 		 769 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  21.82 
 
 		 767 aa  147  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  23.11 
 
 		 760 aa  146  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  23.06 
 
 		 843 aa  146  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  22.75 
 
 		 784 aa  146  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  24.15 
 
 		 768 aa  146  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.84 
 
 		 829 aa  145  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.95 
 
 		 770 aa  144  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.66 
 
 		 761 aa  144  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.72 
 
 		 769 aa  144  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  22.35 
 
 		 843 aa  144  9e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1489  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.56 
 
 		 780 aa  143  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.83 
 
 		 781 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  23.73 
 
 		 785 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  22.83 
 
 		 781 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  23.11 
 
 		 795 aa  142  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.47 
 
 		 787 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.9 
 
 		 769 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.64 
 
 		 844 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  24.14 
 
 		 786 aa  141  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  24.14 
 
 		 786 aa  141  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.78 
 
 		 854 aa  141  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.25 
 
 		 758 aa  140  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  23.86 
 
 		 844 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.31 
 
 		 799 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.49 
 
 		 857 aa  139  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.15 
 
 		 841 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.73 
 
 		 784 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  22.59 
 
 		 763 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  23.15 
 
 		 758 aa  138  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  22.22 
 
 		 852 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  23.54 
 
 		 785 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.32 
 
 		 821 aa  138  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000592139  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  23.44 
 
 		 910 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>