More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1211 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1211  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 163 aa  315  2e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  60.67 
 
 		 165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1258  lipoprotein signal peptidase  64.94 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07781  lipoprotein signal peptidase  46.21 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.246414  normal  0.0597023 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  40.79 
 
 		 157 aa  102  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  40.6 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 		 158 aa  101  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 167 aa  97.1  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  39.22 
 
 		 169 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  38.69 
 
 		 160 aa  91.3  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  38.56 
 
 		 169 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  33.82 
 
 		 154 aa  89.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  45.61 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10211  putative lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 		 158 aa  87.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.148717  normal  0.209845 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  41.1 
 
 		 207 aa  85.9  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09461  lipoprotein signal peptidase  38.73 
 
 		 151 aa  84.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0146  lipoprotein signal peptidase  46.22 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  37.18 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1558  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.714607  decreased coverage  0.00460941 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  27.95 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  27.95 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  36.76 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  35.59 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  31.36 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  40.85 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  41.3 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0885  lipoprotein signal peptidase  32.43 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0111972  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  32.84 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  35.42 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09981  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  32.7 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 272 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06350  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.27868  normal  0.129428 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  35.42 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  36.96 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  36.69 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  31.88 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  31.21 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  31.33 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2580  lipoprotein signal peptidase  39.72 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  36.43 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  29.17 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  34.01 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  37.4 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  38.73 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  37.69 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0052  lipoprotein signal peptidase  30.67 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  33.8 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  32.14 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  35.95 
 
 		 358 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  31.06 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2249  lipoprotein signal peptidase  37.34 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.464022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  38.64 
 
 		 155 aa  72  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  36.72 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0037  lipoprotein signal peptidase  29.33 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.251395 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  30 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  34.27 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  31.25 
 
 		 235 aa  70.9  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  33.77 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  37.21 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  44.03 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  32.08 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3017  lipoprotein signal peptidase  40.98 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0840  lipoprotein signal peptidase  31.34 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  41.27 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>