More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0223 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0251  BCCT family glycine betaine transporter  88.58 
 
 		 516 aa  824    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0223  BCCT family glycine betaine transporter  100 
 
 		 518 aa  1004    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16031  hypothetical protein  61.6 
 
 		 519 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.034717  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3860  BCCT family transporter  40.87 
 
 		 519 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5577  BCCT family osmoprotectant transporter  40.12 
 
 		 522 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5298  BCCT family osmoprotectant transporter  40.32 
 
 		 522 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5694  BCCT family osmoprotectant transporter  40.32 
 
 		 522 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5539  osmoprotectant transporter, BCCT family  40.32 
 
 		 522 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5125  BCCT family osmoprotectant transporter  40.32 
 
 		 522 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5140  BCCT family osmoprotectant transporter  40.9 
 
 		 522 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5625  osmoprotectant transporter, BCCT family  39.92 
 
 		 522 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5380  osmoprotectant transporter, BCCT family  40.72 
 
 		 522 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.274616  normal  0.0982886 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5569  osmoprotectant transporter, BCCT family  40.32 
 
 		 522 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5237  BCCT transporter  39.92 
 
 		 522 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0815  BCCT transporter  38.75 
 
 		 530 aa  359  8e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.820785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0335  BCCT transporter  41.89 
 
 		 534 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.568613  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2888  BCCT transporter  41.77 
 
 		 555 aa  354  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696836  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3674  BCCT transporter  40.32 
 
 		 549 aa  354  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2126  BCCT transporter  40.28 
 
 		 533 aa  353  5.9999999999999994e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00109884  hitchhiker  0.00218719 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3383  BCCT transporter  41.72 
 
 		 514 aa  352  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.198067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1238  BCCT transporter  38.66 
 
 		 554 aa  342  5.999999999999999e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332872 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0875  glycine betaine transporter OpuD  40.08 
 
 		 524 aa  342  7e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0576373  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06536  choline/carnitine/betaine transporter  39.2 
 
 		 539 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000659  putative glycine betaine transporter  39.44 
 
 		 528 aa  338  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1813  BCCT transporter  38.26 
 
 		 561 aa  337  2.9999999999999997e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0579  choline-glycine betaine transporter  38.96 
 
 		 519 aa  335  1e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2887  BCCT transporter  41.16 
 
 		 529 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2692  BCCT family transporter  41.49 
 
 		 516 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3060  BCCT transporter  41.91 
 
 		 516 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2920  BCCT transporter  42.76 
 
 		 518 aa  322  8e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00190717  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2467  BCCT transporter  40.76 
 
 		 537 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  31.08 
 
 		 532 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  31.69 
 
 		 516 aa  234  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  33.47 
 
 		 508 aa  232  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  31.76 
 
 		 606 aa  229  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  33.4 
 
 		 567 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  32.78 
 
 		 516 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  32.78 
 
 		 516 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  32.57 
 
 		 516 aa  227  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  32.43 
 
 		 659 aa  227  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  32.43 
 
 		 659 aa  227  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  32.79 
 
 		 657 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  32.57 
 
 		 516 aa  226  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  32.57 
 
 		 516 aa  226  8e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  32.57 
 
 		 516 aa  226  9e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  33.41 
 
 		 550 aa  224  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  31.3 
 
 		 516 aa  225  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  32.29 
 
 		 516 aa  223  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  32.36 
 
 		 516 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  34.01 
 
 		 498 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  30.6 
 
 		 551 aa  219  1e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  30.43 
 
 		 505 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  33.26 
 
 		 545 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  30.6 
 
 		 504 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  31.42 
 
 		 661 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  30.43 
 
 		 504 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  34.74 
 
 		 524 aa  217  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  30.22 
 
 		 505 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  33.05 
 
 		 660 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  30.22 
 
 		 505 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  30.22 
 
 		 505 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2119  betaine/carnitine/choline transporter family protein  33.33 
 
 		 524 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  30.22 
 
 		 505 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  30.22 
 
 		 505 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22610  choline/carnitine/betaine transport  30.41 
 
 		 663 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  30.52 
 
 		 505 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  30.22 
 
 		 505 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  30 
 
 		 504 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  31.5 
 
 		 546 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  30.09 
 
 		 585 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  30.74 
 
 		 548 aa  213  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  30.74 
 
 		 548 aa  213  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  31.74 
 
 		 661 aa  213  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  31.95 
 
 		 494 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10935  glycine betaine transport integral membrane protein betP  33.92 
 
 		 593 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0835  choline/carnitine/betaine transporter  31.94 
 
 		 574 aa  212  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  31.4 
 
 		 542 aa  211  3e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  29.98 
 
 		 490 aa  211  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  32.27 
 
 		 506 aa  211  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  31.71 
 
 		 544 aa  210  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  30.43 
 
 		 573 aa  209  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  30.75 
 
 		 580 aa  209  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  28.99 
 
 		 526 aa  208  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  30.32 
 
 		 667 aa  207  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1337  choline/carnitine/betaine transport  31.07 
 
 		 687 aa  207  4e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  31.49 
 
 		 541 aa  207  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  30.94 
 
 		 538 aa  207  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  31.26 
 
 		 503 aa  206  6e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  30.53 
 
 		 497 aa  206  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2125  choline/carnitine/betaine transport  30.75 
 
 		 549 aa  206  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  30.85 
 
 		 600 aa  206  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06510  choline/carnitine/betaine transport  31.28 
 
 		 642 aa  206  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  30.44 
 
 		 637 aa  204  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0600  choline/carnitine/betaine transporter  27.45 
 
 		 584 aa  204  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000857259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12990  choline transporter  29.19 
 
 		 653 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.283179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0184  BCCT transporter  30.28 
 
 		 602 aa  202  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1805  choline/carnitine/betaine transporter  32.9 
 
 		 664 aa  203  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.376035  hitchhiker  0.00814736 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  28.05 
 
 		 530 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  28.49 
 
 		 538 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0077  choline/carnitine/betaine transporter  32.05 
 
 		 546 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>