More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1430 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1430  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  865    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  64.08 
 
 		 410 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2659  hypothetical protein  64.3 
 
 		 421 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  55.21 
 
 		 411 aa  476  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05402  hypothetical protein  56.45 
 
 		 411 aa  450  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2535  protein of unknown function DUF214  31.99 
 
 		 412 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  29.69 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  25.71 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  28.14 
 
 		 830 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0435  hypothetical protein  28.33 
 
 		 431 aa  152  8.999999999999999e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.131989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2374  ABC-type transport system, permease component  28.09 
 
 		 409 aa  149  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000200206  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1663  protein of unknown function DUF214  29.65 
 
 		 535 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  29.44 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05401  hypothetical protein  27.32 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001464  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  27.14 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  26.27 
 
 		 407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  27.47 
 
 		 406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2498  hypothetical protein  27.27 
 
 		 380 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00553555  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  27.27 
 
 		 415 aa  123  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2901  hypothetical protein  27.79 
 
 		 411 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0934048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2497  hypothetical protein  27.11 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3197  hypothetical protein  26.07 
 
 		 427 aa  120  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2660  hypothetical protein  26.27 
 
 		 410 aa  117  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2395  hypothetical protein  26.68 
 
 		 404 aa  116  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111806  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1429  hypothetical protein  26.4 
 
 		 411 aa  112  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1691  protein of unknown function DUF214  28.86 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  27.44 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0369  hypothetical protein  26.6 
 
 		 403 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2903  hypothetical protein  24.59 
 
 		 410 aa  99.8  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  25.3 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.53 
 
 		 419 aa  99.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  21.7 
 
 		 419 aa  97.4  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2020  protein of unknown function DUF214  25.4 
 
 		 411 aa  95.5  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000619382  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  25.78 
 
 		 389 aa  94  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.06 
 
 		 411 aa  90.1  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  22.73 
 
 		 407 aa  88.6  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.28 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23240  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  23.42 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  23.64 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3383  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.32 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  31.58 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0370  hypothetical protein  25.94 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1747  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.81 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1622  protein of unknown function DUF214  23.57 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  23.38 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  24.31 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  23.67 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  23.48 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  24.03 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2654  ABC transporter, permease protein  27.11 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0708496 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  30.67 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  25.41 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  24.31 
 
 		 422 aa  79.7  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19660  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  21.46 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1547  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.33 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124688  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  26.7 
 
 		 413 aa  79.7  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  23.82 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23270  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  22.12 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.19 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  31.18 
 
 		 656 aa  78.2  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  24.19 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.12 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0857  protein of unknown function DUF214  24.29 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.20592  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.39 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2233  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.62 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3586  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.69 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  28.73 
 
 		 843 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1697  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.69 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934342 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0078  hypothetical protein  25.08 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000923125  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1673  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.58 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  24.83 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.19 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2156  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.39 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  30.94 
 
 		 653 aa  74.7  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2203  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family protein  23.12 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  23.67 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0895  hypothetical protein  21.62 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00465052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  32.73 
 
 		 657 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  23.13 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.43 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  25.06 
 
 		 651 aa  73.6  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  33.59 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  25.53 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1906  hypothetical protein  22.32 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000396781  hitchhiker  0.00508578 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.7 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  24.16 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  25 
 
 		 367 aa  72  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.35 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.71 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  20.89 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2089  protein of unknown function DUF214  20.96 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00149352  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2111  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  22.03 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.04 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.62 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  23.46 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1118  hypothetical protein  22.84 
 
 		 661 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0279794 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1359  permease, putative  22.4 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00178118  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0418  protein of unknown function DUF214  23.76 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2749  hypothetical protein  22.99 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0349567  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  22.54 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>