73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4945 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4945  nuclease  100 
 
 		 170 aa  348  3e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  39.37 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2972  nuclease  41.51 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4764  nuclease  43.4 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00156339  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8127  nuclease  33.33 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3964  nuclease  43.43 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4671  nuclease (SNase-like)  42.73 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3139  nuclease (SNase-like)  31.82 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0817  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9184  nuclease protein  41.3 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1966  putative transmembrane protein  41.51 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113674  normal  0.424222 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  36.59 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  41.44 
 
 		 201 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  36.67 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  32.32 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  38.46 
 
 		 172 aa  52.4  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  31.45 
 
 		 228 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  33.85 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  35.29 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0240  nuclease (SNase-like)  35.45 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  37.14 
 
 		 272 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  33.86 
 
 		 168 aa  48.5  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  35.34 
 
 		 169 aa  48.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  27.35 
 
 		 286 aa  48.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  33.04 
 
 		 278 aa  47.8  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0781  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 114 aa  47.8  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0368621  normal  0.0365666 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  29.27 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0029  nuclease (SNase-like)  34.51 
 
 		 196 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2354  nuclease (SNase-like)  35.11 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  38.1 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06071  micrococcal nuclease  32.99 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.312315  normal  0.542138 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  26.77 
 
 		 247 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2567  nuclease  32.76 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.190384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  39.58 
 
 		 273 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  38.14 
 
 		 273 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  32.19 
 
 		 240 aa  45.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  35.79 
 
 		 202 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  36.7 
 
 		 214 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  35 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5158  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.275699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  34.78 
 
 		 276 aa  45.1  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  31.65 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  33.66 
 
 		 178 aa  44.7  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3627  hypothetical protein  29.25 
 
 		 241 aa  44.3  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  33.85 
 
 		 232 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3796  hypothetical protein  31.43 
 
 		 139 aa  44.3  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000706753  unclonable  0.000000150422 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  36.21 
 
 		 167 aa  44.3  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3789  SNase-like nuclease  33.33 
 
 		 131 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0300901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  36.84 
 
 		 284 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3328  hypothetical protein  33.63 
 
 		 241 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.291078 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  31.63 
 
 		 333 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  36 
 
 		 273 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  31.4 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  34.31 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  29.55 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  27.2 
 
 		 256 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1467  Excalibur domain-containing protein  25.44 
 
 		 259 aa  43.1  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  31.15 
 
 		 221 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1381  micrococcal nuclease-like protein  41.33 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0429202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0608  nuclease  30.77 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  33.03 
 
 		 247 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  35 
 
 		 255 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  36.36 
 
 		 196 aa  42.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  26.74 
 
 		 260 aa  42.4  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5258  nuclease  34.65 
 
 		 170 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  29.75 
 
 		 255 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  34.04 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  30.95 
 
 		 191 aa  41.2  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  31.86 
 
 		 209 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  35.16 
 
 		 169 aa  40.8  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  35.56 
 
 		 176 aa  40.8  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  29.57 
 
 		 227 aa  40.4  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>