More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1950 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 232 aa  457  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  65.22 
 
 		 229 aa  291  5e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  61.11 
 
 		 224 aa  232  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  50.22 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  49.33 
 
 		 242 aa  197  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  40.97 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  39.49 
 
 		 243 aa  111  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  32.84 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  31.95 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  35.33 
 
 		 521 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  33.65 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  33.65 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  33.65 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  33.65 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  33.65 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  33.65 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  29.81 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  30.35 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  31.34 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  29.33 
 
 		 401 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  36.18 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  30.54 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  32.42 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  32.54 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  33.19 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  31.15 
 
 		 567 aa  76.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  29.85 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  29.21 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  29.57 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  28.35 
 
 		 517 aa  75.1  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  30.21 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  31.98 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  30.64 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  31.18 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  30.23 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  31.84 
 
 		 862 aa  73.9  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  29.35 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  29.35 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  28.64 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  32.76 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  32.76 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  32.76 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  29.49 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  28.37 
 
 		 358 aa  72.4  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  29.49 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  31.18 
 
 		 227 aa  72  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  30.05 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  28.34 
 
 		 734 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  31.07 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  25.27 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  29.23 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  28.05 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  26.51 
 
 		 949 aa  70.5  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  29.13 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  30.05 
 
 		 576 aa  69.7  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  31.44 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  26.86 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  33.51 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  27.96 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  27.37 
 
 		 447 aa  68.9  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  26.86 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  26.86 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  30.53 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  30.57 
 
 		 870 aa  68.9  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  32.18 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  26.94 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  32.11 
 
 		 441 aa  68.6  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  30.48 
 
 		 363 aa  68.9  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  27.66 
 
 		 348 aa  68.6  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  30.06 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  27.96 
 
 		 386 aa  68.2  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  28.64 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  28.33 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  27.08 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  33.51 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  30.09 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  29.86 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  30.15 
 
 		 191 aa  68.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  31.05 
 
 		 493 aa  68.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  32.62 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  32.89 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  28.64 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0707  pentapeptide repeat protein  31.02 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  32.78 
 
 		 456 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  26.89 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  27.59 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  31.94 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  27.8 
 
 		 366 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  30.9 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  31.49 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  30.84 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  30.61 
 
 		 710 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  29.59 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  29.59 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  30.77 
 
 		 844 aa  66.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>