80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0407 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0407  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 177 aa  343  6e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644736  normal  0.04042 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1754  TPR repeat-containing protein  48.41 
 
 		 184 aa  141  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107491  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1029  tetratricopeptide TPR_2  49.04 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1590  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.18 
 
 		 294 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 643 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 3172 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0360  tetratricopeptide TPR_2  29.25 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 		 3301 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 		 754 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  31.03 
 
 		 1154 aa  48.9  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 968 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 804 aa  48.9  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0006  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 287 aa  48.5  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  32.98 
 
 		 643 aa  48.5  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  35.59 
 
 		 340 aa  48.5  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 931 aa  48.5  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 		 754 aa  48.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  29.2 
 
 		 299 aa  48.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 394 aa  47.8  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 265 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.01 
 
 		 778 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3236  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.076369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.71 
 
 		 1022 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.65 
 
 		 784 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 593 aa  44.7  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 1276 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4454  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 177 aa  44.7  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.43 
 
 		 190 aa  44.7  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1069 aa  44.3  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 		 1252 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 377 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  34 
 
 		 883 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2007  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.67 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3702  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.604438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.95 
 
 		 988 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  32.97 
 
 		 545 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 		 1252 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 		 1737 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 688 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0580  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 319 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0151  cellulose synthase subunit BcsC  38.95 
 
 		 1157 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2192  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 		 319 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000199858  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.31 
 
 		 818 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.98 
 
 		 839 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  37.66 
 
 		 729 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 597 aa  42.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 211 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  33.91 
 
 		 1159 aa  42.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.68 
 
 		 1056 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  31.87 
 
 		 444 aa  42.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0074  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.17 
 
 		 967 aa  42  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 587 aa  42  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.57 
 
 		 689 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.07 
 
 		 539 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1796  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2197  TPR repeat-containing protein  40.74 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.85 
 
 		 1056 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1771  Tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 339 aa  41.6  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.678894  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 187 aa  42  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.44 
 
 		 208 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 351 aa  41.6  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  31.76 
 
 		 734 aa  41.6  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 289 aa  41.6  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 900 aa  41.6  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3867  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.78 
 
 		 967 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4375  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.07 
 
 		 540 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0399  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 1112 aa  41.6  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2305  TPR repeat-containing protein  39.62 
 
 		 307 aa  41.6  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 927 aa  41.2  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  25.93 
 
 		 287 aa  41.2  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.589169  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 878 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.17 
 
 		 389 aa  41.2  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1557  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.17 
 
 		 390 aa  41.2  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3457  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 		 152 aa  41.2  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.98 
 
 		 248 aa  40.8  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 389 aa  40.8  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1338  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 		 931 aa  40.8  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  38.67 
 
 		 884 aa  40.8  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>