82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36940 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  340  5e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  48.05 
 
 		 155 aa  147  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  49.31 
 
 		 193 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  45.83 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  48.59 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  40.48 
 
 		 169 aa  120  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  40 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  41.73 
 
 		 152 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  41.43 
 
 		 153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  45.26 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  45.26 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  45.26 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2741  hypothetical protein  40.28 
 
 		 232 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  38.55 
 
 		 239 aa  99.8  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2566  transcriptional regulator, MarR family  35.46 
 
 		 237 aa  97.1  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  0.11891 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  39.13 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  38.1 
 
 		 316 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  38.1 
 
 		 158 aa  92.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5015  hypothetical protein  38.51 
 
 		 244 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  33.11 
 
 		 157 aa  88.2  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0456  transcriptional regulator, MarR family  38.97 
 
 		 251 aa  86.3  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0033  hypothetical protein  36.67 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0501  transcriptional regulator, MarR family  39.69 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3324  transcriptional regulator, MarR family  38.17 
 
 		 268 aa  74.3  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0275415  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  30.82 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  29.53 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  29.93 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  31.08 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  29.33 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0167  hypothetical protein  32.45 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  25.98 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  34.06 
 
 		 213 aa  60.8  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  26.95 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  39.29 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  28.47 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02225  hypothetical protein  29.71 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.479286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  27.21 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  32.35 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  28.12 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  24.65 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  30.26 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  36.05 
 
 		 192 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  36.47 
 
 		 192 aa  51.2  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  32.06 
 
 		 214 aa  51.2  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  29.53 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  30.08 
 
 		 217 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  32.09 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  25.47 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  27.01 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  29.08 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  31.48 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  28.22 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  29.08 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  27.54 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  31.2 
 
 		 186 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  31.2 
 
 		 186 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  30.59 
 
 		 192 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3364  ArsR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 193 aa  47.8  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  32.94 
 
 		 194 aa  47.8  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  33.33 
 
 		 166 aa  47.4  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  35.71 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  30.68 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  32.94 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  35.71 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  30.4 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  27.14 
 
 		 207 aa  45.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  27.2 
 
 		 183 aa  44.7  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  31.03 
 
 		 168 aa  44.3  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 198 aa  44.3  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  25.33 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1483  putative transcriptional regulator  29.09 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3853  putative transcriptional regulator  34.21 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1829  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.140183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0439  transcriptional regulators-like protein  31.4 
 
 		 167 aa  41.2  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179863  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  32.74 
 
 		 460 aa  41.6  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1692  transcriptional regulator-like protein  31.33 
 
 		 201 aa  41.2  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0735  hypothetical protein  31.43 
 
 		 187 aa  41.2  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  27.33 
 
 		 173 aa  41.2  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  25.17 
 
 		 168 aa  40.8  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>