More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26830 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  100 
 
 		 291 aa  575  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  70.1 
 
 		 292 aa  411  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  65.17 
 
 		 294 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  65.17 
 
 		 297 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  63.23 
 
 		 303 aa  363  2e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  61.38 
 
 		 295 aa  338  5e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  62.2 
 
 		 305 aa  338  7e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  56.16 
 
 		 341 aa  302  5.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  53.61 
 
 		 406 aa  295  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  51.74 
 
 		 326 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  53.98 
 
 		 293 aa  286  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  53.98 
 
 		 292 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  54.64 
 
 		 318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  52.72 
 
 		 303 aa  281  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  54.48 
 
 		 307 aa  278  6e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  51.21 
 
 		 298 aa  277  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  50.69 
 
 		 293 aa  277  1e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  52.08 
 
 		 326 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  51.9 
 
 		 290 aa  276  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  53.54 
 
 		 305 aa  275  8e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  53.61 
 
 		 317 aa  272  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  38.14 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.54 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  36.81 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  36.49 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  35.86 
 
 		 299 aa  205  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  35.86 
 
 		 299 aa  205  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  39.31 
 
 		 299 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.39 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  39.73 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  36.77 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  37.93 
 
 		 296 aa  198  7.999999999999999e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  37.05 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  43.06 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.52 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  34.84 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  33.79 
 
 		 294 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.91 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 319 aa  192  8e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  36.9 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  33.79 
 
 		 321 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  35.84 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  32.55 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  36.73 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  33.56 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  38.57 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  34.27 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  38.72 
 
 		 315 aa  180  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  31.89 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  33.92 
 
 		 298 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  34.01 
 
 		 304 aa  178  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  34.03 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  32.29 
 
 		 296 aa  177  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  32.99 
 
 		 294 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  32.3 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  32.3 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  32.3 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  31.96 
 
 		 294 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  29.83 
 
 		 309 aa  172  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  36.88 
 
 		 316 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  32.3 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  35.14 
 
 		 266 aa  171  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  31.96 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  31.96 
 
 		 303 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  31.96 
 
 		 294 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  31.62 
 
 		 294 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  40.65 
 
 		 318 aa  169  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  32.3 
 
 		 303 aa  168  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  35.65 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  38.05 
 
 		 293 aa  162  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  39.19 
 
 		 295 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  39.93 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  36.15 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  32.42 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.57 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  36.73 
 
 		 244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  38.82 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  36.28 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  39.18 
 
 		 340 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  38.04 
 
 		 344 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  34.26 
 
 		 298 aa  152  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1572  ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.33 
 
 		 305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  34.34 
 
 		 314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  37.97 
 
 		 320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  37.16 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  35.59 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  38.79 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  36.65 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  38.54 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  37.44 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  37.61 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  31.86 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  32.05 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2113  ABC transporter related  35.27 
 
 		 303 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  38.43 
 
 		 261 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2329  ABC transporter-like protein  36.36 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.613206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>