More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4182 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 231 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  90.48 
 
 		 232 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91873  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.97 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.67 
 
 		 227 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0180181  normal  0.277757 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0974  short chain dehydrogenase  50.45 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0177058  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39280  short chain dehydrogenase  50.9 
 
 		 230 aa  190  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1729  short chain dehydrogenase  45.78 
 
 		 227 aa  184  8e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7025  short chain dehydrogenase  45.05 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0854  short chain dehydrogenase  44.1 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0159157 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.64 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6051  short chain dehydrogenase  43.36 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0202908  normal  0.993323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1778  oxidoreductase, short chain dehydrogenase  46.85 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25540  short-chain alcohol dehydrogenase  45.54 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5763  short chain dehydrogenase  42.73 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5387  short chain dehydrogenase  42.73 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5476  short chain dehydrogenase  42.73 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0679291  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 		 280 aa  128  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3934  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 261 aa  121  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  0.058004 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00230  short-chain alcohol dehydrogenase  41.85 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  31.88 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  31.88 
 
 		 242 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.93 
 
 		 249 aa  105  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 		 317 aa  102  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.51 
 
 		 250 aa  101  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09810  short-chain alcohol dehydrogenase  36.21 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0913042  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  31.3 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  32.22 
 
 		 1270 aa  99.8  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 314 aa  99  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 277 aa  99.4  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1347  short chain dehydrogenase  38.97 
 
 		 258 aa  98.6  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.371645 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.61 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  30.9 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.640458 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.8 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 		 338 aa  97.4  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.09 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.09 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 		 283 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.820059  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 		 279 aa  96.7  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  33.71 
 
 		 272 aa  96.7  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.06 
 
 		 250 aa  96.3  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  34.39 
 
 		 274 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.99 
 
 		 254 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 		 272 aa  95.5  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37020  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  36.16 
 
 		 279 aa  95.5  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  31.67 
 
 		 241 aa  95.5  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  32.31 
 
 		 246 aa  94.7  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 252 aa  95.1  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0691773  normal  0.0221679 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0679  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 		 250 aa  94.7  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22723  normal  0.897045 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.84 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.88898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 		 348 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5800  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 		 258 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 		 253 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 306 aa  94.7  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3866  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 		 258 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4503  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 		 258 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0184  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.9 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24130  short-chain alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1596  short chain dehydrogenase  32.62 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.184756 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 		 300 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0169  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 289 aa  93.2  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.56 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 348 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.53 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2586  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 348 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 		 246 aa  92.8  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1627  oxidoreductase  29.61 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 		 269 aa  92.8  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 270 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 		 250 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 		 272 aa  92.4  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 283 aa  92.4  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.406068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 		 242 aa  92.4  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 		 273 aa  92.4  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 244 aa  92  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 285 aa  92.4  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 248 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 248 aa  92.4  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.02 
 
 		 284 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.72 
 
 		 251 aa  91.7  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10492  short-chain type oxidoreductase  36.65 
 
 		 251 aa  92  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 		 245 aa  91.7  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 		 245 aa  92  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 		 248 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172179  normal  0.840489 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1406  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.51 
 
 		 248 aa  91.7  9e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000194485  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4862  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.2 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000522303  unclonable  0.000000385865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.97 
 
 		 256 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.565969  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>