More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8535 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 166 aa  339  9e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  78.79 
 
 		 166 aa  276  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  74.7 
 
 		 167 aa  269  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  75.15 
 
 		 167 aa  266  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  74.55 
 
 		 166 aa  265  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  62.35 
 
 		 162 aa  209  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  62.18 
 
 		 160 aa  202  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  61.64 
 
 		 164 aa  201  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  59.64 
 
 		 164 aa  195  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  61.64 
 
 		 160 aa  194  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  58.54 
 
 		 164 aa  189  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  56.1 
 
 		 172 aa  187  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  58.71 
 
 		 161 aa  185  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  58.08 
 
 		 165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  56.77 
 
 		 163 aa  176  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  56.1 
 
 		 162 aa  174  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  53.89 
 
 		 167 aa  175  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  57.86 
 
 		 160 aa  174  6e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  59.49 
 
 		 160 aa  174  6e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  56.63 
 
 		 160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 		 164 aa  172  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  56.6 
 
 		 163 aa  169  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  55.21 
 
 		 161 aa  167  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 164 aa  157  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  53.29 
 
 		 164 aa  157  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  48.8 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  48.8 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  48.8 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  52.76 
 
 		 167 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  47.02 
 
 		 164 aa  151  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  46.43 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  48.5 
 
 		 165 aa  147  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  47.59 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  48.5 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  50.3 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  47.68 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  45.86 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  44.3 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  39.29 
 
 		 157 aa  94.7  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  40.54 
 
 		 156 aa  94.7  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  39.29 
 
 		 164 aa  91.3  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  38.3 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  38.1 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  35.71 
 
 		 162 aa  87.4  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  37.16 
 
 		 160 aa  87  9e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  37.67 
 
 		 157 aa  87.4  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  34.72 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  39.57 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  38.57 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  35.66 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  34.97 
 
 		 160 aa  85.1  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  35.25 
 
 		 156 aa  84  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  35.66 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  35.46 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  35.25 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  35.29 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  35.29 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  35.29 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  35.46 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  36.88 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  34.75 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  35.92 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  33.1 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  34.87 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  34.21 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  35.66 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  33.57 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  34.44 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  35.76 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  36.62 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0158  transcription elongation factor GreA  34.19 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3597  GreA/GreB family elongation factor  40.86 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0995544  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  34.53 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  32.68 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  34.21 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3574  transcription elongation factor GreA  33.56 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  hitchhiker  0.00344058 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  35.14 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  35.86 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0977  transcription elongation factor GreA  34.03 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  37.16 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  36.65 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  35.8 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0951  GreA/GreB family elongation factor  34.59 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000196364  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  38.67 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  34.19 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2837  transcription elongation factor GreA  32.9 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107078  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0997  transcription elongation factor GreA  34.84 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00368773  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  33.55 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1240  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  33.81 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  35.81 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3402  transcription elongation factor GreA  35.86 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000615218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3073  transcription elongation factor GreA  35.53 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  35.81 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  34.29 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  35.14 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  32.41 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>