More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8019 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  100 
 
 		 238 aa  461  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  90.34 
 
 		 241 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  83.19 
 
 		 239 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  78.99 
 
 		 246 aa  373  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  79.83 
 
 		 238 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  80.51 
 
 		 239 aa  371  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  79.75 
 
 		 239 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  78.9 
 
 		 239 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  79.24 
 
 		 240 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  77.64 
 
 		 240 aa  367  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  75.95 
 
 		 244 aa  356  1.9999999999999998e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  77.22 
 
 		 244 aa  353  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  74.79 
 
 		 240 aa  348  4e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  72.27 
 
 		 239 aa  337  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  71.85 
 
 		 239 aa  336  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  71.61 
 
 		 238 aa  316  2e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  74.89 
 
 		 238 aa  313  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  66.09 
 
 		 266 aa  311  4.999999999999999e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  67.81 
 
 		 258 aa  311  5.999999999999999e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  66.96 
 
 		 228 aa  266  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  66.96 
 
 		 228 aa  267  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  62.5 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 307 aa  244  9e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  62.56 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  57.75 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  58.8 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  56.94 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  56.94 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  56.94 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  57.41 
 
 		 233 aa  221  9e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  57.87 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  56.17 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  54.47 
 
 		 237 aa  215  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  56.94 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1477  transcriptional regulator, IclR family  56.94 
 
 		 237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.958166  normal  0.570733 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  57.59 
 
 		 241 aa  209  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  56.62 
 
 		 220 aa  208  7e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  36.82 
 
 		 252 aa  120  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  31.93 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  32.34 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  32.34 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 272 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 272 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 266 aa  95.1  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  33.05 
 
 		 246 aa  92.8  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 248 aa  92.8  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 249 aa  92.4  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 249 aa  92.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 249 aa  92.4  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 249 aa  92.4  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 249 aa  92.4  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 249 aa  92.4  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  34.6 
 
 		 270 aa  91.7  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2981  transcriptional regulator, IclR family  35.37 
 
 		 285 aa  89.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 249 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 249 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  34.8 
 
 		 276 aa  88.6  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 		 273 aa  88.6  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  36.74 
 
 		 242 aa  88.2  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6026  IclR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.221801 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 266 aa  87  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 262 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  29.11 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  34.53 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  32.68 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4707  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  32.08 
 
 		 249 aa  85.9  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4871  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5463  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5399  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  decreased coverage  0.00269642 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  27.85 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  33.04 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  27.85 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  27.85 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  29.83 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  27.85 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>