More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7391 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  100 
 
 		 434 aa  825    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  47.03 
 
 		 435 aa  260  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  47.86 
 
 		 411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  45.48 
 
 		 426 aa  246  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 432 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  40.76 
 
 		 461 aa  202  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  39.43 
 
 		 402 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 456 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  35.22 
 
 		 411 aa  179  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  42.23 
 
 		 420 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 416 aa  173  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  37.63 
 
 		 406 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 416 aa  167  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  33.92 
 
 		 451 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 429 aa  162  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 421 aa  162  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  36.39 
 
 		 417 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 397 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  36.39 
 
 		 417 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  36.39 
 
 		 418 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  36.39 
 
 		 418 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  36.39 
 
 		 418 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  36.39 
 
 		 397 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  37.63 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  36.43 
 
 		 417 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 		 418 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  33.65 
 
 		 432 aa  154  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  35.57 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  32.35 
 
 		 414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  35.18 
 
 		 408 aa  142  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  42.8 
 
 		 467 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  36.7 
 
 		 420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 420 aa  129  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  32.94 
 
 		 401 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 412 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 405 aa  124  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 405 aa  124  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 441 aa  123  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 		 416 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  37.4 
 
 		 289 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 		 430 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  35.33 
 
 		 408 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 431 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 420 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 426 aa  108  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 410 aa  106  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 444 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  34.08 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  22.38 
 
 		 423 aa  99  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  35.69 
 
 		 439 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  29.26 
 
 		 419 aa  97.1  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 420 aa  96.7  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  31.3 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 451 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 461 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 436 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  30 
 
 		 543 aa  93.2  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4989  hypothetical protein  31.39 
 
 		 342 aa  93.2  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 428 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  25 
 
 		 413 aa  92.4  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  25 
 
 		 413 aa  92.4  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 439 aa  92.8  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  34.98 
 
 		 526 aa  92.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  30.55 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  26.9 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 436 aa  91.3  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  22.96 
 
 		 432 aa  90.1  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  30.77 
 
 		 409 aa  90.1  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  25 
 
 		 390 aa  89.7  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  25 
 
 		 390 aa  89.7  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  22.86 
 
 		 417 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 405 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  29.63 
 
 		 535 aa  87.4  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 421 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  22.14 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  22.85 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  30.19 
 
 		 549 aa  86.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  22.5 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  22.51 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>