100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4989 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4989  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  671    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  27.83 
 
 
397 aa  92.4  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  26.38 
 
 
418 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  27.51 
 
 
418 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  27.51 
 
 
418 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  26.38 
 
 
417 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  26.38 
 
 
417 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  27.51 
 
 
397 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
411 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 
429 aa  82.4  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  27.86 
 
 
435 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  27.24 
 
 
456 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  25.95 
 
 
432 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  30.03 
 
 
427 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  26.17 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 
433 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  30.89 
 
 
434 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  28.32 
 
 
408 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  23.18 
 
 
414 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  26.41 
 
 
408 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25.7 
 
 
408 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  24.08 
 
 
410 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.39 
 
 
405 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  25.7 
 
 
408 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.39 
 
 
405 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 
418 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25.7 
 
 
408 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  26.52 
 
 
406 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  23.1 
 
 
417 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  26.86 
 
 
415 aa  63.5  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  23.24 
 
 
414 aa  63.2  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  25.7 
 
 
408 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  25.7 
 
 
408 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  23.28 
 
 
417 aa  60.1  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 
415 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  26.55 
 
 
420 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  22.98 
 
 
461 aa  57  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  27.04 
 
 
408 aa  56.6  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 
439 aa  56.6  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
447 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  25.08 
 
 
428 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 
405 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  24.91 
 
 
426 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 
405 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 
432 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  22.93 
 
 
414 aa  54.3  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  22.63 
 
 
414 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 
408 aa  52.8  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.01 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 
442 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.01 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 
417 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 
432 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  27.14 
 
 
378 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  26.71 
 
 
415 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  27.14 
 
 
415 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  30 
 
 
419 aa  50.8  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  27.14 
 
 
378 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  27.14 
 
 
378 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  25.09 
 
 
420 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 
412 aa  49.7  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  24.91 
 
 
408 aa  49.3  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  26.35 
 
 
431 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 
451 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 
441 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  30.4 
 
 
415 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
467 aa  47  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  24.82 
 
 
436 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 
414 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  23.89 
 
 
411 aa  46.6  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  34.88 
 
 
414 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0504  major facilitator family transporter  28.03 
 
 
410 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.280977  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
420 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
420 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  34 
 
 
425 aa  46.2  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  24.84 
 
 
424 aa  46.2  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 
406 aa  46.2  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  39.22 
 
 
416 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0456  major facilitator family transporter  27.62 
 
 
410 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0890515  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  23.72 
 
 
421 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  22.86 
 
 
421 aa  45.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 
432 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 
430 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  25.32 
 
 
423 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  25.32 
 
 
423 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  25.32 
 
 
423 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  25.32 
 
 
423 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 
435 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  25.81 
 
 
423 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.34 
 
 
446 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0311  transporter, putative  28.77 
 
 
542 aa  43.9  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.054545  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  25.96 
 
 
423 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0504  major facilitator family transporter  26.78 
 
 
410 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4868  major facilitator family transporter  27.62 
 
 
410 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  25.28 
 
 
416 aa  43.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 
420 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0287  putative transporter  28.87 
 
 
542 aa  43.1  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  23.25 
 
 
426 aa  43.1  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  25.96 
 
 
423 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0371  major facilitator transporter  27.2 
 
 
405 aa  42.4  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>