250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6487 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6487  putative carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
127 aa  254  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10786  4-carboxymuconolactone decarboxylase  49.07 
 
 
143 aa  118  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.898844 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3850  Carboxymuconolactone decarboxylase  53.1 
 
 
130 aa  107  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4575  carboxymuconolactone decarboxylase  44.44 
 
 
146 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4663  carboxymuconolactone decarboxylase  44.44 
 
 
146 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173189  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4958  carboxymuconolactone decarboxylase  44.44 
 
 
146 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268542  normal  0.217933 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1603  carboxymuconolactone decarboxylase  44.04 
 
 
149 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5154  carboxymuconolactone decarboxylase  43.33 
 
 
152 aa  101  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  59.09 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0322  carboxymuconolactone decarboxylase  39.51 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0333  carboxymuconolactone decarboxylase  39.51 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1906  carboxymuconolactone decarboxylase  37.21 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528731  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0343  carboxymuconolactone decarboxylase  39.51 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3396  carboxymuconolactone decarboxylase  38.27 
 
 
266 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.346548  normal  0.629357 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.36 
 
 
107 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1910  carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  41.25 
 
 
262 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5179  carboxymuconolactone decarboxylase  29.75 
 
 
123 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351451  normal  0.0612334 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.65 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.24 
 
 
402 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  32.79 
 
 
393 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  34.74 
 
 
276 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1806  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.84 
 
 
255 aa  57.8  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0201167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.48 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  35.44 
 
 
396 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.48 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.48 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  41.77 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.46 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.21 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.44 
 
 
398 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5713  Carboxymuconolactone decarboxylase  35 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  40.3 
 
 
256 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.56 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  31.53 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1438  carboxymuconolactone decarboxylase  32.97 
 
 
308 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  32.14 
 
 
259 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  34.09 
 
 
396 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0608  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.8 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  28.7 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2692  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.29 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00273056  normal  0.231258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4793  carboxymuconolactone decarboxylase  27.5 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.575162  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4879  carboxymuconolactone decarboxylase  27.5 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0552117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33 
 
 
393 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 
393 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 
393 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 
393 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 
393 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 
393 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  30.84 
 
 
129 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.84 
 
 
126 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  42.47 
 
 
380 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  34.34 
 
 
268 aa  54.7  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  41.18 
 
 
238 aa  54.3  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.33 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_003296  RS03072  4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  37.93 
 
 
108 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3089  carboxymuconolactone decarboxylase  43.75 
 
 
265 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0644  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.45 
 
 
138 aa  52.8  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3046  carboxymuconolactone decarboxylase  43.06 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0606  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.45 
 
 
138 aa  52.8  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  29.91 
 
 
129 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.83 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.78 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0717  carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.226817  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3459  carboxymuconolactone decarboxylase  35.58 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1216  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.38 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0658576  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  27.78 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  29.91 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1085  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  30.11 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0564788  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2469  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.799907  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  31.82 
 
 
397 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.69 
 
 
122 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  35.29 
 
 
127 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  27.69 
 
 
396 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0448  carboxymuconolactone decarboxylase  31.43 
 
 
131 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1984  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.3 
 
 
134 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5222  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.04 
 
 
126 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  30.91 
 
 
129 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0381  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.43 
 
 
131 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.07667  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.03 
 
 
134 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.67 
 
 
152 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4219  carboxymuconolactone decarboxylase  32.05 
 
 
252 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2482  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.11 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156087  normal  0.0594202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  27.91 
 
 
397 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  27.78 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  32.11 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
131 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2086  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.11 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000641307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2018  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.21 
 
 
107 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0370669  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  33.8 
 
 
239 aa  50.8  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.37 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  28.7 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.14 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.7 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.7 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.7 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.48 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3284  carboxymuconolactone decarboxylase  30.12 
 
 
198 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  30.25 
 
 
125 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  35.53 
 
 
261 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>