70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5284 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5284  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  373  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2000  transcriptional regulator, TetR family  66.84 
 
 		 189 aa  234  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.564621  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  60.21 
 
 		 206 aa  221  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  61.9 
 
 		 205 aa  219  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5854  hypothetical protein  55.61 
 
 		 190 aa  201  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1480  hypothetical protein  54.5 
 
 		 190 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473033  normal  0.172398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4231  regulatory protein TetR  56.68 
 
 		 188 aa  176  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19390  transcriptional regulator, tetR family  51.34 
 
 		 189 aa  157  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  44.83 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 		 191 aa  111  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  37.97 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  38.37 
 
 		 183 aa  95.9  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0128  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 191 aa  91.7  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0714  transcriptional regulator, TetR family  39.27 
 
 		 197 aa  89.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113218 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  29.89 
 
 		 185 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  29.12 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  29.12 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0927  putative transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.594816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  41 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  41 
 
 		 208 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  41 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1631  transcriptional regulator  26.97 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0987628 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  36.63 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 196 aa  48.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 238 aa  48.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 250 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 174 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 235 aa  44.7  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1551  hypothetical protein  26.95 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.494685  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 233 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  23.02 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10310  transcriptional regulator, tetR family  36.14 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  26.12 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 256 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24780  transcriptional regulator, tetR family  26.44 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 223 aa  42  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  37.5 
 
 		 225 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 180 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  37.5 
 
 		 225 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  37.5 
 
 		 225 aa  42  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 224 aa  42  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 239 aa  41.2  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 235 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 205 aa  41.2  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>