More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4707 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4707  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  30 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  30.88 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  29.02 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 337 aa  75.5  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  30.33 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1277  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460205  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2802  GntR domain-containing protein  30.45 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2669  GntR domain-containing protein  30.45 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2591  GntR domain protein  31.22 
 
 		 501 aa  74.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00937291  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  31.82 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13077  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 490 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.207808  normal  0.861389 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  28.07 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  28.64 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  28.64 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  28.64 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  28.64 
 
 		 250 aa  72  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  27.1 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 255 aa  71.6  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 279 aa  72  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1778  GntR domain-containing protein  32.8 
 
 		 267 aa  71.6  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.393282  normal  0.0406668 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  30.13 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1289  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  28 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  29.13 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3603  GntR domain protein  25.6 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  28.51 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  28.63 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  27.73 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  27.91 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  27.73 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  27.73 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  27.73 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  29.07 
 
 		 264 aa  68.6  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  27.88 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3206  regulatory protein GntR, HTH  32.09 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  25.11 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2979  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0803123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4780  regulatory protein GntR HTH  28.64 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  27.73 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  28.25 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  31.79 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  27.44 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  26.85 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  27.31 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  29.82 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  28.31 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4409  GntR domain protein  29.58 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  28.51 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  27.52 
 
 		 242 aa  67  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3342  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  28.31 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3778  transcriptional regulator PdhR  27.73 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  28.37 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0318  transcriptional regulator PdhR  27.73 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  29.05 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4447  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  25.78 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0430  transcriptional regulator PdhR  27.73 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096101 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6080  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  28.04 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  28.05 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  32.19 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3531  transcriptional regulator NanR  26.82 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0974768  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3213  regulatory protein GntR HTH  25.23 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5052  transcriptional regulator  31.45 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3700  transcriptional regulator NanR  26.82 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  29.25 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  27.56 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3533  transcriptional regulator NanR  26.82 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.606366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3638  transcriptional regulator NanR  26.82 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4100  transcriptional regulator, GntR family  27.03 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000122034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3349  regulatory protein GntR, HTH  28.7 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3643  GntR domain-containing protein  34.13 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4221  GntR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000881899  normal  0.895287 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  28.96 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>