More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3266 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 511 aa  1051    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  83.14 
 
 		 512 aa  897    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  59.14 
 
 		 517 aa  649    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  58.63 
 
 		 512 aa  620  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  59.25 
 
 		 513 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  58.27 
 
 		 514 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.93 
 
 		 518 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.68 
 
 		 514 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0221  AMP-dependent synthetase and ligase  58.94 
 
 		 510 aa  606  9.999999999999999e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  57.14 
 
 		 514 aa  599  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.87 
 
 		 512 aa  600  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.09 
 
 		 516 aa  578  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.95 
 
 		 512 aa  556  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.06 
 
 		 506 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.97 
 
 		 516 aa  536  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.67 
 
 		 506 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.67 
 
 		 506 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.4 
 
 		 516 aa  533  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  54.22 
 
 		 546 aa  529  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  52.05 
 
 		 520 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  53.41 
 
 		 522 aa  522  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  51.95 
 
 		 516 aa  523  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.07 
 
 		 522 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  50.78 
 
 		 516 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.93 
 
 		 536 aa  511  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.098527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  51.47 
 
 		 516 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  52.89 
 
 		 517 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  49.71 
 
 		 515 aa  509  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  50.29 
 
 		 516 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  52.08 
 
 		 501 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  50.29 
 
 		 516 aa  505  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.09 
 
 		 537 aa  503  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  52.08 
 
 		 501 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  52.08 
 
 		 501 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  50.59 
 
 		 511 aa  503  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  49.51 
 
 		 515 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  49.51 
 
 		 515 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  49.51 
 
 		 515 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  49.11 
 
 		 509 aa  480  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  48.62 
 
 		 527 aa  477  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6056  AMP-dependent synthetase and ligase  47.83 
 
 		 515 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0696  AMP-dependent synthetase and ligase  45.26 
 
 		 521 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.36 
 
 		 516 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  46.09 
 
 		 524 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0121  AMP-dependent synthetase and ligase  45.9 
 
 		 522 aa  395  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  44.94 
 
 		 521 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  45.09 
 
 		 525 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.58 
 
 		 515 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  43.68 
 
 		 525 aa  379  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.05 
 
 		 522 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  42.77 
 
 		 487 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  43.08 
 
 		 492 aa  354  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.88 
 
 		 516 aa  329  7e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  41.72 
 
 		 508 aa  325  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  40.36 
 
 		 519 aa  317  3e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.49 
 
 		 524 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.61 
 
 		 543 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.69 
 
 		 514 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.35 
 
 		 509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.42 
 
 		 509 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  38.6 
 
 		 492 aa  303  5.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.15 
 
 		 509 aa  302  8.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.78 
 
 		 499 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  37.33 
 
 		 510 aa  298  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.76 
 
 		 500 aa  297  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  37.6 
 
 		 518 aa  295  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.97 
 
 		 497 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.97 
 
 		 497 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.9 
 
 		 501 aa  286  7e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3247  AMP-dependent synthetase and ligase  37.18 
 
 		 497 aa  270  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.640388 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.05 
 
 		 513 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1600  AMP-dependent synthetase and ligase  34.24 
 
 		 496 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 		 532 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  34.41 
 
 		 518 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.94 
 
 		 526 aa  247  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  36.2 
 
 		 492 aa  247  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  35.32 
 
 		 509 aa  246  6e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  34.11 
 
 		 523 aa  245  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  34.33 
 
 		 495 aa  243  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.7 
 
 		 525 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 515 aa  243  6e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  32.54 
 
 		 509 aa  243  9e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.49 
 
 		 525 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  34.12 
 
 		 520 aa  240  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  35.07 
 
 		 517 aa  239  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  35.51 
 
 		 520 aa  239  8e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1599  AMP-dependent synthetase and ligase  34.4 
 
 		 484 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  32.81 
 
 		 499 aa  237  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 		 511 aa  236  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 		 527 aa  236  9e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0252  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 		 484 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122402 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.82 
 
 		 525 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0223  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 491 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.803967  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0233  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 491 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1112  putative acyl-CoA ligase  33.86 
 
 		 504 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  32.49 
 
 		 521 aa  233  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 		 526 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  36.57 
 
 		 493 aa  233  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 		 512 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  31.61 
 
 		 544 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>