151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2172 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  49.41 
 
 		 248 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  45.1 
 
 		 243 aa  198  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  37.5 
 
 		 289 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2318  hypothetical protein  32.16 
 
 		 565 aa  116  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115468  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  32.25 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1204  hypothetical protein  55.29 
 
 		 338 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102705  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0794  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.83 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898651  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  27.84 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  28.02 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  27.74 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  22.57 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  26.37 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  26.37 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  23.61 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  31.75 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  21.94 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  38.89 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  23.15 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  26.25 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  22.61 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  26.73 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  25.19 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  25.19 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  37.68 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  28.12 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  23.05 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  23.67 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  21.91 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3481  hypothetical protein  44.29 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  21.88 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  25.17 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  21.88 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  21.55 
 
 		 303 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  32.05 
 
 		 441 aa  57  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  22.73 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  20.63 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  24.03 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  20.85 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  31.75 
 
 		 374 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  21.2 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  23.79 
 
 		 312 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  21.2 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  26.74 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  36 
 
 		 362 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  36 
 
 		 360 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  36 
 
 		 360 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1623  hypothetical protein  36.84 
 
 		 378 aa  53.9  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0072792  hitchhiker  0.000000117284 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  36 
 
 		 336 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  36 
 
 		 387 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  36 
 
 		 387 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  36 
 
 		 336 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  36 
 
 		 387 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  30.43 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  24.4 
 
 		 281 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  22.85 
 
 		 289 aa  53.1  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  23.85 
 
 		 267 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 312 aa  52  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0849  Cro/CI family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 130 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  24.12 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  21.05 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  21.05 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  22.9 
 
 		 311 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  35.82 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 334 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 339 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  28.57 
 
 		 380 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  28.57 
 
 		 376 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 339 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  28.57 
 
 		 375 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  27.84 
 
 		 393 aa  50.4  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  30 
 
 		 436 aa  50.4  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7851  putative dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component  41.54 
 
 		 138 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187793  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  27.4 
 
 		 307 aa  49.7  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  26.72 
 
 		 263 aa  49.7  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  26.72 
 
 		 210 aa  50.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  21.07 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  23.97 
 
 		 340 aa  49.7  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 342 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 196 aa  49.3  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  24.19 
 
 		 321 aa  49.3  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0624  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 272 aa  49.3  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  21.26 
 
 		 295 aa  48.9  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 334 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  23.08 
 
 		 273 aa  48.9  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 338 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  30.14 
 
 		 347 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 338 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  30.14 
 
 		 348 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  25.44 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  30 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 325 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  32.81 
 
 		 340 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>