190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1942 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1942  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  593  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  55.97 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8407  hypothetical protein  55.41 
 
 		 314 aa  277  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  48.59 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1436  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.18 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397565  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5067  hypothetical protein  44.7 
 
 		 310 aa  189  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  43.28 
 
 		 351 aa  173  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.03 
 
 		 335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  38.19 
 
 		 365 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.5 
 
 		 348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  37.77 
 
 		 357 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  37.95 
 
 		 342 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  37.74 
 
 		 359 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  37.42 
 
 		 359 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  37.42 
 
 		 359 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  34.52 
 
 		 320 aa  126  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.89 
 
 		 341 aa  125  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.43 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  34.59 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  34.57 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1854  hypothetical protein  35.51 
 
 		 295 aa  89  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.96 
 
 		 331 aa  87  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1792  hypothetical protein  36.64 
 
 		 314 aa  86.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.56 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.1 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.97 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.41 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  27.27 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.26 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25.87 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3998  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.9 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.631873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.71 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  26.9 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  28.33 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.13 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.36 
 
 		 520 aa  60.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  23.53 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  26.73 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  24.52 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  24.04 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  24.32 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  22.74 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.86 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.96 
 
 		 530 aa  57  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.23 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  25.93 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.99 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4267  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.27 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0357814  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  21.58 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  21.85 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3425  hypothetical protein  32.92 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.87 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  21.59 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1499  protein of unknown function DUF6  30.12 
 
 		 249 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0456527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  22.22 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  22.86 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  21.58 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1824  hypothetical protein  30.12 
 
 		 249 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.21 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  22.22 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  25.57 
 
 		 299 aa  53.9  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.71 
 
 		 296 aa  53.5  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3333  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.09 
 
 		 293 aa  53.5  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.73 
 
 		 290 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  22.49 
 
 		 296 aa  53.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2238  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.37 
 
 		 310 aa  52.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01360  predicted permease, DMT superfamily  30.58 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.554543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  25.51 
 
 		 289 aa  52.8  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  23.84 
 
 		 305 aa  52.8  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  31.82 
 
 		 309 aa  52.8  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  24.35 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  28.15 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  30.54 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.67 
 
 		 335 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3433  hypothetical protein  28.48 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302271  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.8 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.76 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  25.52 
 
 		 297 aa  50.8  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  22.74 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  21.48 
 
 		 308 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  21.43 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  25.52 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3085  hypothetical protein  27.46 
 
 		 295 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0753098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  30 
 
 		 318 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  22.93 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  21.65 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2469  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.31 
 
 		 293 aa  49.7  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  31.9 
 
 		 278 aa  49.7  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  21.03 
 
 		 308 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  21.03 
 
 		 308 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  27.27 
 
 		 296 aa  49.7  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  23.78 
 
 		 304 aa  49.3  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.37 
 
 		 305 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.61 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  27.48 
 
 		 288 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2406  DMT family permease  20.66 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  19.11 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  21.69 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  22.93 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>