More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1867 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  100 
 
 
281 aa  541  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  62.83 
 
 
276 aa  341  7e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  57.68 
 
 
290 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  53.38 
 
 
308 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  51.88 
 
 
311 aa  248  7e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  50.75 
 
 
293 aa  242  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  49.08 
 
 
313 aa  236  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  50.59 
 
 
368 aa  235  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  49.81 
 
 
348 aa  225  6e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  50.36 
 
 
308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
281 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  50.92 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  43.97 
 
 
292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  43.68 
 
 
292 aa  209  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  46.04 
 
 
289 aa  206  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  47.19 
 
 
339 aa  205  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  44.28 
 
 
284 aa  202  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  46.44 
 
 
441 aa  201  8e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  46.26 
 
 
296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  44.88 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  44.88 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  44.88 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  45.8 
 
 
287 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  45.26 
 
 
352 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  49.06 
 
 
484 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  41.18 
 
 
297 aa  186  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  40.21 
 
 
306 aa  182  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  45.08 
 
 
280 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  44.33 
 
 
302 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.52 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  40.93 
 
 
301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  37.02 
 
 
322 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  36.56 
 
 
306 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  39.08 
 
 
291 aa  151  8.999999999999999e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  37.25 
 
 
278 aa  123  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  31.58 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  51.82 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  28.67 
 
 
343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  50.47 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  39.63 
 
 
291 aa  109  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.91 
 
 
475 aa  109  6e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  48.33 
 
 
282 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  46.85 
 
 
279 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  46.43 
 
 
280 aa  106  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  44.67 
 
 
270 aa  106  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  52.59 
 
 
278 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  30.16 
 
 
281 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  36.52 
 
 
303 aa  102  6e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  44.78 
 
 
280 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  43.6 
 
 
281 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  44.67 
 
 
256 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  38.85 
 
 
282 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  39.08 
 
 
266 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.22 
 
 
281 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  40.88 
 
 
287 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  30.87 
 
 
258 aa  100  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  47.71 
 
 
285 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  39.67 
 
 
281 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  41.61 
 
 
271 aa  100  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  45.95 
 
 
269 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  43.8 
 
 
284 aa  99.8  5e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  42.4 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  36.61 
 
 
285 aa  99  7e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  48.6 
 
 
277 aa  99  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  41.94 
 
 
265 aa  99  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  45.83 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  36.99 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  43.54 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  41.13 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  46.73 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  46.73 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  47.06 
 
 
268 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  39.75 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  47.27 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  42.02 
 
 
269 aa  97.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  47.06 
 
 
271 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  29.55 
 
 
261 aa  97.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  46.67 
 
 
271 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  48.33 
 
 
285 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  34.17 
 
 
280 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1486  phosphatidate cytidylyltransferase  40.4 
 
 
290 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00292599  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  33.76 
 
 
307 aa  96.3  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  43.65 
 
 
273 aa  96.3  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  34.15 
 
 
287 aa  96.3  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  38.07 
 
 
280 aa  95.9  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  44.54 
 
 
280 aa  95.9  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  45.16 
 
 
282 aa  96.3  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  31.79 
 
 
242 aa  95.9  6e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  48.33 
 
 
285 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  48.33 
 
 
285 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  40.22 
 
 
271 aa  95.9  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  40.22 
 
 
271 aa  95.9  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  48.33 
 
 
285 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  48.33 
 
 
285 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  48.33 
 
 
285 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  34.55 
 
 
341 aa  95.9  7e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  48.33 
 
 
285 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  48.33 
 
 
285 aa  95.9  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2897  phosphatidate cytidylyltransferase  40.4 
 
 
285 aa  95.5  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00110713  normal  0.164322 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  46.9 
 
 
294 aa  95.5  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>