More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0635 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  100 
 
 		 204 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  90.69 
 
 		 204 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  90.2 
 
 		 204 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  89.71 
 
 		 204 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  89.22 
 
 		 204 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4039  HAD superfamily hydrolase  75.5 
 
 		 202 aa  323  7e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0526  HAD family hydrolase  75.12 
 
 		 210 aa  323  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3600  HAD family hydrolase  75 
 
 		 206 aa  321  6e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3426  HAD family hydrolase  75.77 
 
 		 203 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0371  HAD family hydrolase  58.03 
 
 		 205 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0499  HAD superfamily hydrolase  53.33 
 
 		 204 aa  218  6e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  42.29 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  40.36 
 
 		 172 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  42.13 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  39.15 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0523  hydrolase, HAD-family protein  39.2 
 
 		 203 aa  124  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0171673  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05409  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 		 204 aa  114  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2257  HAD family hydrolase  41.03 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  38.24 
 
 		 196 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001470  HAD-superfamily hydrolase  34.43 
 
 		 206 aa  112  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12890  hypothetical protein  38.78 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753603  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3457  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.86 
 
 		 210 aa  107  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1167  hypothetical protein  37.76 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  32.7 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.72 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2814  HAD family hydrolase  40.76 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4659  HAD-superfamily hydrolase  40.51 
 
 		 184 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  38.2 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0694  HAD family hydrolase  36.94 
 
 		 214 aa  104  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4915  HAD family hydrolase  38.2 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000596857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4773  HAD family hydrolase  38.07 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  38.95 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3718  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 197 aa  101  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.52 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29989  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4761  HAD superfamily hydrolase  37.08 
 
 		 196 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000261111  hitchhiker  0.00232434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4635  HAD family hydrolase  37.08 
 
 		 196 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262111  hitchhiker  0.00233323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.13 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5811  predicted protein  34.12 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695872  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3448  HAD family hydrolase  39.62 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87850  predicted protein  34.81 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.762716  normal  0.0707375 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04278  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1 and 3  38.31 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  26.83 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  28.02 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  28.42 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  26.83 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  27.32 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  27.54 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  26.83 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  30.11 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  34.18 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  30.34 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  25.23 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  26.09 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1710  HAD family hydrolase  27.93 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  24.66 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  25.82 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  34.87 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  28.91 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  29.05 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.71 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.423006  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2132  HAD family hydrolase  29.78 
 
 		 220 aa  62  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  28.35 
 
 		 224 aa  62  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  27.87 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1688  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  32.7 
 
 		 193 aa  62  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168366  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1868  hypothetical protein  27.1 
 
 		 257 aa  61.6  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  32.04 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  29.55 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  26.97 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  26.97 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2235  phosphoglycolate phosphatase 2  28.09 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  27.46 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  24.73 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  28.65 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4716  phosphoglycolate phosphatase  26.74 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.74 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.09 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  27.05 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.38 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  38.14 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2414  phosphoglycolate phosphatase, putative  27.56 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  27.72 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  38.14 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2289  HAD family hydrolase  26.37 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000247556  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2151  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  27.96 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  26.18 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2065  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0943577  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  27.08 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2056  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.37 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0324232  unclonable  0.00000000000163854 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  25.4 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2061  HAD family hydrolase  28.1 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0183643  unclonable  0.0000224709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2406  HAD family hydrolase  26.37 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0211635  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.07 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2060  HAD family hydrolase  26.37 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00381556  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  27.32 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  30.68 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.42 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3208  hydrolase  25.14 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>