More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2274 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2274  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  629  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  44.91 
 
 		 303 aa  256  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0347  transcriptional regulator, LysR family  41.28 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0327  LysR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107285  normal  0.389567 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1059  transcriptional regulator, LysR family  41.41 
 
 		 324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 311 aa  232  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 301 aa  228  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 298 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  40.46 
 
 		 324 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7268  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 321 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  39.86 
 
 		 296 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  38.74 
 
 		 314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 301 aa  219  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3219  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.888048  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  40.48 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  38.28 
 
 		 294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 324 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7340  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532831  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4575  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.80821 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 310 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 310 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 310 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  41.75 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 305 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5802  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 300 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3868  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 306 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4501  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 306 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 296 aa  208  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  39.37 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  39.37 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1349  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.352605 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 302 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3302  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 298 aa  206  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  38.23 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 302 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2684  transcriptional regulator, LysR family  38.94 
 
 		 306 aa  205  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 296 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 314 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3825  hypothetical protein  39.39 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  41.18 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  37.1 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0489  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 311 aa  203  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.24 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  37.24 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  37.24 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  41.18 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  36.81 
 
 		 301 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 302 aa  202  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1934  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 306 aa  202  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252542 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0217  transcriptional regulator, LysR family  38.82 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3113  transcriptional regulator LysR family  38.6 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  36.84 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3142  LysR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3801  carbonate dehydratase  38.82 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1997  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32470  Transcriptional regulator LysR family protein  36.84 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1897  LysR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  37.41 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2283  LysR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95602  normal  0.350255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4699  transcriptional regulator, LysR family  38 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  0.119558 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2502  LysR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47080  putative transcriptional regulator  38.62 
 
 		 302 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.881505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0900  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 300 aa  196  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 297 aa  196  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2586  carbonate dehydratase  36.52 
 
 		 296 aa  195  9e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4298  transcriptional regulator, LysR family  37.97 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6689  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1212  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  36.81 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1231  transcriptional regulator, LysR family  37.28 
 
 		 304 aa  193  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3350  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1902  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1168  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1528  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.442273  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4562  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 		 298 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.195043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3304  LysR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 313 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0884385 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8328  transcriptional regulator, LysR family  39.3 
 
 		 310 aa  193  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1924  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 		 302 aa  192  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>