More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3951 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  100 
 
 
512 aa  1025    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  56.07 
 
 
521 aa  514  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2264  amidohydrolase 3  54.29 
 
 
498 aa  478  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000406056  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  48.97 
 
 
518 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5320  Amidohydrolase 3  48.32 
 
 
553 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  45.2 
 
 
552 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  45.9 
 
 
548 aa  341  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2198  Amidohydrolase 3  45.45 
 
 
520 aa  337  3.9999999999999995e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1929  Amidohydrolase 3  43.59 
 
 
551 aa  333  5e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  44.85 
 
 
563 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1873  Amidohydrolase 3  43.25 
 
 
542 aa  322  7e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0350767 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2186  amidohydrolase 3  39.71 
 
 
558 aa  322  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0899437  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3420  amidohydrolase 3  42.88 
 
 
526 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103675  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1776  Amidohydrolase 3  39.96 
 
 
559 aa  317  3e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2501  amidohydrolase 3  43.47 
 
 
530 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2546  amidohydrolase 3  43.47 
 
 
530 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.799273  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2538  amidohydrolase 3  43.28 
 
 
530 aa  316  6e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749351  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12089  hypothetical protein  42.44 
 
 
534 aa  311  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300172  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2702  Amidohydrolase 3  42.04 
 
 
513 aa  309  8e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  41.04 
 
 
539 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2484  Amidohydrolase 3  40.99 
 
 
541 aa  300  4e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1889  Amidohydrolase 3  42.72 
 
 
547 aa  293  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0946427  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2936  Amidohydrolase 3  41.82 
 
 
546 aa  293  7e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000940592  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3116  amidohydrolase 3  42.51 
 
 
526 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0541679  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14070  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  39.96 
 
 
522 aa  268  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00157439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1293  Amidohydrolase 3  36.26 
 
 
541 aa  254  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.958478  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  30.31 
 
 
520 aa  199  7.999999999999999e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  32.04 
 
 
540 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.7 
 
 
583 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  26.21 
 
 
505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  30.2 
 
 
553 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  30.75 
 
 
530 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  30.56 
 
 
532 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29.58 
 
 
556 aa  148  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  30.79 
 
 
568 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  30.72 
 
 
485 aa  140  4.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  28.6 
 
 
540 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  27.43 
 
 
546 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  28.57 
 
 
535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  26.78 
 
 
452 aa  135  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  27.24 
 
 
537 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  30.84 
 
 
539 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  27.29 
 
 
562 aa  133  7.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  27.34 
 
 
541 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  28.93 
 
 
542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  25.59 
 
 
539 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  26.57 
 
 
550 aa  127  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  29.38 
 
 
579 aa  120  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  29.31 
 
 
537 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  23.53 
 
 
533 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.2 
 
 
565 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  27.63 
 
 
542 aa  117  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  25.79 
 
 
557 aa  117  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  26.4 
 
 
543 aa  117  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  26.07 
 
 
553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  26.09 
 
 
556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  29.14 
 
 
543 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  28.1 
 
 
556 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  27.47 
 
 
527 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  23.48 
 
 
520 aa  110  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  26.61 
 
 
601 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  29.6 
 
 
537 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1394  putative metal-dependent hydrolase  29.01 
 
 
484 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  25.9 
 
 
560 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  26.01 
 
 
555 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  28.75 
 
 
522 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  25.49 
 
 
548 aa  107  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  25.5 
 
 
540 aa  107  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  25.86 
 
 
543 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  26.72 
 
 
554 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0778  amidohydrolase 3  27.59 
 
 
499 aa  105  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.674672  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  24.45 
 
 
549 aa  104  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  28.99 
 
 
548 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1660  amidohydrolase 3  24 
 
 
435 aa  103  7e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  25.3 
 
 
546 aa  103  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  26.19 
 
 
545 aa  103  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  30 
 
 
536 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  27.19 
 
 
565 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  25.09 
 
 
543 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  23 
 
 
522 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  30.13 
 
 
544 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  23.72 
 
 
543 aa  99.4  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  23.18 
 
 
539 aa  99.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  24.26 
 
 
544 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06500  conserved hypothetical protein  26.94 
 
 
513 aa  98.6  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  25.66 
 
 
619 aa  99  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  21.72 
 
 
522 aa  98.2  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  24.48 
 
 
569 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  28.26 
 
 
545 aa  97.8  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  23.87 
 
 
563 aa  97.8  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2956  Amidohydrolase 3  28.57 
 
 
492 aa  98.2  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  26.86 
 
 
583 aa  97.8  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  25.73 
 
 
575 aa  97.8  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  21.72 
 
 
522 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.07 
 
 
575 aa  97.4  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27442  predicted protein  29.41 
 
 
453 aa  97.4  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.44874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  29.21 
 
 
548 aa  97.4  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  26.05 
 
 
541 aa  97.1  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  25.81 
 
 
604 aa  96.3  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  28.3 
 
 
549 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>