187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0080 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  100 
 
 		 286 aa  576  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  32.33 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  35.88 
 
 		 322 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  22.36 
 
 		 316 aa  90.1  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  26.74 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  35.88 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  27.92 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  28.36 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  29.55 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  27.82 
 
 		 355 aa  79.3  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  25.37 
 
 		 317 aa  79  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  26.99 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  34.94 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  33.79 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  26.77 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  31.41 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  29.48 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  26.67 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.16 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  30.37 
 
 		 544 aa  73.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  33.92 
 
 		 357 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  27.24 
 
 		 378 aa  72.4  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  23.25 
 
 		 464 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  25.45 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  28.09 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  33.07 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  29.35 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.28 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  23.21 
 
 		 325 aa  68.9  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  27.08 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  33.09 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  33.97 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  28.79 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2820  esterase, PHB depolymerase family  27.34 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000611867  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.37 
 
 		 323 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  31.78 
 
 		 429 aa  67  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.28 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1969  esterase, PHB depolymerase  26.89 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  32.62 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  29.49 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  30.77 
 
 		 414 aa  65.9  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  27.27 
 
 		 361 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  31.01 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  26.24 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  26.67 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1984  esterase, PHB depolymerase family  27 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000502853  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  33.08 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  31.65 
 
 		 419 aa  62.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  30.23 
 
 		 396 aa  62.4  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  25.73 
 
 		 795 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.8 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  22.73 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  31.03 
 
 		 1002 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  34.4 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  23.91 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3819  PHB depolymerase family esterase  34.11 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  33.6 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  23.9 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  27.78 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4127  esterase, PHB depolymerase family  33.33 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  30.95 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  30.16 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  30.87 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  28.17 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  31.4 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  28.21 
 
 		 659 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  28.17 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  29.32 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  28.17 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  23.55 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  28.87 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  28.8 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  23.55 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.46 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  28.17 
 
 		 369 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  31.75 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  32.17 
 
 		 368 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  25.2 
 
 		 370 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  26.84 
 
 		 387 aa  57  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5706  PHB depolymerase family esterase  33.33 
 
 		 438 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137114  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0209  esterase, PHB depolymerase family  24.66 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  33.33 
 
 		 451 aa  55.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  33.33 
 
 		 518 aa  55.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  28.92 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  32.06 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  29.2 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2204  esterase, PHB depolymerase  26.55 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4615  PHB depolymerase family esterase  29.19 
 
 		 359 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  29.66 
 
 		 392 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  25.45 
 
 		 338 aa  53.9  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3360  esterase, PHB depolymerase family  25.57 
 
 		 419 aa  54.3  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.995755 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06093  Acetylxylan esterase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS5]  30.37 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00247339 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  31.98 
 
 		 232 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.89 
 
 		 298 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  36.07 
 
 		 381 aa  52.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0284  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  31.52 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4362  PHB depolymerase family esterase  31.9 
 
 		 576 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  31.4 
 
 		 529 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7065  esterase, PHB depolymerase family  27.27 
 
 		 426 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185362  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6025  PHB depolymerase family esterase  26.82 
 
 		 416 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950963  normal  0.103792 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>