More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3314 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  100 
 
 
973 aa  1985    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2303  TonB-dependent receptor  41.48 
 
 
982 aa  676    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243733  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64710  putative extracellular heme-binding protein  37.85 
 
 
989 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.572363  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5620  putative extracellular heme-binding protein  37.58 
 
 
930 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253718  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2186  TonB-dependent receptor  32.77 
 
 
1040 aa  420  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.996858  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4301  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 
1018 aa  368  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.15211 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3189  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 
728 aa  287  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1523  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 
1045 aa  233  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  31.74 
 
 
1186 aa  229  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2679  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 
1054 aa  204  7e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0566  heme receptor HasR  31.46 
 
 
784 aa  180  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.44 
 
 
892 aa  163  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0130  TonB-dependent heme receptor HasR  22.47 
 
 
830 aa  130  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  28.39 
 
 
861 aa  128  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  29.37 
 
 
859 aa  125  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.9 
 
 
867 aa  125  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4086  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.47 
 
 
783 aa  125  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3894  TonB-dependent heme receptor HasR  22.36 
 
 
830 aa  122  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2389  TonB-dependent receptor  33.55 
 
 
823 aa  119  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.687523  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.99 
 
 
862 aa  118  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  28.97 
 
 
857 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.97 
 
 
862 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  32.63 
 
 
862 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1720  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  26.66 
 
 
885 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  26.8 
 
 
891 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  32.14 
 
 
851 aa  101  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.96 
 
 
849 aa  100  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  32.14 
 
 
851 aa  100  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  30.04 
 
 
661 aa  97.8  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.79 
 
 
669 aa  94.7  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.34 
 
 
892 aa  92.4  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  26.67 
 
 
778 aa  91.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  29.93 
 
 
660 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.05 
 
 
717 aa  89.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  29.93 
 
 
660 aa  89  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 
822 aa  88.2  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  31.3 
 
 
676 aa  85.5  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  31.3 
 
 
676 aa  85.1  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  31.3 
 
 
676 aa  85.1  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  27.64 
 
 
783 aa  83.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.82 
 
 
778 aa  83.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.8 
 
 
779 aa  82.4  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 
817 aa  80.9  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0115  tonB-dependent receptor  23.64 
 
 
753 aa  79.7  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  38.97 
 
 
778 aa  79.3  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.44 
 
 
722 aa  79.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.53 
 
 
685 aa  78.6  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.74 
 
 
694 aa  78.2  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  38.1 
 
 
836 aa  76.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.25 
 
 
759 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  31.28 
 
 
764 aa  75.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.95 
 
 
704 aa  75.5  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  32.18 
 
 
844 aa  74.7  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  30.51 
 
 
792 aa  73.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  30.77 
 
 
764 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1051  TonB-dependent outer membrane receptor  25 
 
 
757 aa  73.9  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1603  TonB-dependent receptor, plug  30.09 
 
 
771 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0535477  unclonable  0.000000514373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.32 
 
 
681 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2296  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 
752 aa  72.8  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25 
 
 
743 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.35 
 
 
734 aa  71.6  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  28.46 
 
 
809 aa  71.2  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  36.8 
 
 
883 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  28.06 
 
 
812 aa  70.1  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  27.05 
 
 
689 aa  70.1  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 
778 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  31.13 
 
 
799 aa  68.9  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  30.09 
 
 
812 aa  68.9  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 
815 aa  68.6  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  30.69 
 
 
795 aa  68.6  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3280  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 
923 aa  68.6  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322049  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 
863 aa  68.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  27.9 
 
 
784 aa  68.2  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  41.49 
 
 
864 aa  67.8  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1599  TonB-dependent receptor, plug  31.76 
 
 
800 aa  67.8  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000304489  unclonable  0.000000404036 
 
 
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.4 
 
 
690 aa  67.8  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 
791 aa  67.8  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  25.87 
 
 
774 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  25.87 
 
 
774 aa  67  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  28.52 
 
 
799 aa  67.4  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  25.87 
 
 
774 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 
809 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  24.1 
 
 
777 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 
807 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2220  Secretin/TonB short domain  40 
 
 
226 aa  67.4  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27532  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  27.59 
 
 
791 aa  67.4  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  25.33 
 
 
774 aa  67  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  32.91 
 
 
821 aa  67  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  28.92 
 
 
712 aa  66.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 
835 aa  66.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  38.39 
 
 
833 aa  65.9  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  35.09 
 
 
879 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  42.99 
 
 
973 aa  65.5  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  25.87 
 
 
774 aa  65.5  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  45.83 
 
 
801 aa  65.1  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4201  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  33.33 
 
 
686 aa  65.1  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325691  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 
787 aa  64.7  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2907  secretin/TonB-like protein  36.67 
 
 
226 aa  64.7  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  33.6 
 
 
828 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 
809 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.11228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>