134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2809 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  100 
 
 
396 aa  805    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 
484 aa  226  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  38.23 
 
 
674 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  37.58 
 
 
674 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  37.58 
 
 
674 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  38.51 
 
 
674 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  38.51 
 
 
674 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  38.51 
 
 
674 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  38.51 
 
 
674 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  38.51 
 
 
674 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  34.34 
 
 
382 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  33.06 
 
 
639 aa  210  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  38.2 
 
 
674 aa  210  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  38.2 
 
 
674 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  37.89 
 
 
674 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  36.53 
 
 
521 aa  196  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  33.98 
 
 
372 aa  193  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  34.26 
 
 
652 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  34.43 
 
 
401 aa  187  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  32.13 
 
 
559 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  33.67 
 
 
703 aa  182  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  34.23 
 
 
377 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  31.44 
 
 
482 aa  176  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  32.33 
 
 
388 aa  176  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  31.32 
 
 
373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  33.77 
 
 
430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  34.84 
 
 
763 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  36.88 
 
 
414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  29.72 
 
 
364 aa  164  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  34.03 
 
 
1271 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  31.27 
 
 
455 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  29.41 
 
 
425 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  33.82 
 
 
675 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  32.82 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  29.5 
 
 
451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  32.18 
 
 
762 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  30.9 
 
 
426 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  31.61 
 
 
539 aa  143  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  27.34 
 
 
355 aa  143  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  28.29 
 
 
499 aa  143  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  29.09 
 
 
652 aa  142  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  28.04 
 
 
431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  30.83 
 
 
540 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  30.87 
 
 
662 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  31.5 
 
 
536 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  30.7 
 
 
563 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  29.6 
 
 
634 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  31.51 
 
 
540 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  30.63 
 
 
439 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  31.61 
 
 
472 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  28.5 
 
 
867 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 
1578 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  29.49 
 
 
792 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  32.35 
 
 
532 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  27.6 
 
 
868 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  25.56 
 
 
904 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  27.8 
 
 
657 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  28.02 
 
 
868 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  27.36 
 
 
868 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 
868 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  27.54 
 
 
868 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  25.98 
 
 
1127 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  27.23 
 
 
1051 aa  127  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  25.76 
 
 
1127 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  25.76 
 
 
1127 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  25.76 
 
 
1127 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  30.47 
 
 
854 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  26.88 
 
 
869 aa  124  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3523  glycoside hydrolase family protein  29.18 
 
 
375 aa  123  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.416811  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  28.14 
 
 
398 aa  123  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  27.4 
 
 
863 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  28.46 
 
 
542 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  25.76 
 
 
1053 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  29.18 
 
 
465 aa  119  9e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  29.75 
 
 
1362 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  25.49 
 
 
1129 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  26.38 
 
 
563 aa  115  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  28.46 
 
 
586 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  30.08 
 
 
651 aa  114  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  28.28 
 
 
1146 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  25.73 
 
 
868 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  25.86 
 
 
827 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  28.16 
 
 
848 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  23.81 
 
 
848 aa  110  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  26.9 
 
 
1246 aa  109  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  27.78 
 
 
1080 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  26.87 
 
 
463 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  25.07 
 
 
407 aa  108  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  24.76 
 
 
972 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  24.89 
 
 
855 aa  106  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  28.53 
 
 
772 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  24.38 
 
 
760 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  26.29 
 
 
1443 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  28.97 
 
 
997 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00541  conserved hypothetical protein  26.65 
 
 
1598 aa  101  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  26.79 
 
 
366 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  23.59 
 
 
1132 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  24.58 
 
 
505 aa  97.4  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  27.93 
 
 
1054 aa  96.7  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  27.91 
 
 
861 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>