More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4058 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  37.87 
 
 		 1034 aa  685    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1672  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.6 
 
 		 1054 aa  760    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  38.98 
 
 		 1034 aa  671    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  37.57 
 
 		 1053 aa  664    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  36.95 
 
 		 1048 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  44.84 
 
 		 1021 aa  843    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  37.08 
 
 		 1032 aa  637    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  36.24 
 
 		 1033 aa  665    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  38.96 
 
 		 1033 aa  759    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0614  CzcA family heavy metal efflux protein  36.86 
 
 		 1069 aa  640    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  37.71 
 
 		 1032 aa  716    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3687  CzcA family heavy metal efflux protein  41.73 
 
 		 1049 aa  773    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  68.83 
 
 		 1032 aa  1501    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  37.86 
 
 		 1038 aa  738    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  36.27 
 
 		 1064 aa  643    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  36.97 
 
 		 1032 aa  685    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2752  CzcA family heavy metal efflux protein  39.58 
 
 		 1063 aa  739    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1300  CzcA family heavy metal efflux protein  38.31 
 
 		 1025 aa  707    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.187575  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  37.79 
 
 		 1053 aa  668    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  38.03 
 
 		 1077 aa  684    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  38.31 
 
 		 1077 aa  691    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  37.45 
 
 		 1049 aa  697    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  37.39 
 
 		 1052 aa  683    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  37.27 
 
 		 1054 aa  663    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  38.12 
 
 		 1077 aa  686    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  40.56 
 
 		 1033 aa  746    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  42.72 
 
 		 1029 aa  835    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1550  CzcA family heavy metal efflux protein  36.89 
 
 		 1057 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  37.57 
 
 		 1053 aa  664    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2944  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.6 
 
 		 1054 aa  760    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  37.34 
 
 		 1062 aa  657    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  41.11 
 
 		 1039 aa  793    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4283  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.47 
 
 		 1031 aa  729    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.820694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  37.62 
 
 		 1075 aa  680    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  36.11 
 
 		 1059 aa  652    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  37.64 
 
 		 1070 aa  674    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2911  heavy metal efflux pump CzcA  40.56 
 
 		 1050 aa  769    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  38.31 
 
 		 1077 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  38.57 
 
 		 1045 aa  647    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  36.34 
 
 		 1047 aa  646    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  35.84 
 
 		 1062 aa  644    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  37.4 
 
 		 1456 aa  657    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  38.03 
 
 		 1050 aa  677    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  37.17 
 
 		 1046 aa  652    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  37.75 
 
 		 1070 aa  677    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4985  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.21 
 
 		 1055 aa  750    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00799341 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  38.12 
 
 		 1034 aa  677    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1242  CzcA family heavy metal efflux protein  40.06 
 
 		 1056 aa  734    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.861006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1183  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.37 
 
 		 1056 aa  746    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292353  normal  0.30181 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  40.82 
 
 		 1028 aa  785    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  38.42 
 
 		 1048 aa  679    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  37.57 
 
 		 1053 aa  664    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  37.14 
 
 		 1040 aa  661    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1087  CzcA family heavy metal efflux protein  37.23 
 
 		 1061 aa  639    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  42.72 
 
 		 1019 aa  835    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1546  putative cation efflux system protein  37.75 
 
 		 1079 aa  735    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161901  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  38.22 
 
 		 1077 aa  679    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.94 
 
 		 1034 aa  671    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3933  CzcA family heavy metal efflux protein  37.37 
 
 		 1459 aa  655    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3560  heavy metal efflux pump CzcA  40.69 
 
 		 1040 aa  774    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802571  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  39.35 
 
 		 1062 aa  642    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  37.48 
 
 		 1053 aa  661    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4462  CzcA family heavy metal efflux protein  37.3 
 
 		 1446 aa  655    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.82 
 
 		 1063 aa  655    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3285  CzcA family heavy metal efflux protein  36.66 
 
 		 1048 aa  638    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.571532 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  38.13 
 
 		 1054 aa  684    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  36.81 
 
 		 1031 aa  656    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  40.16 
 
 		 1029 aa  754    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  36.37 
 
 		 1040 aa  659    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  36.86 
 
 		 1046 aa  650    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2358  RND OM permease  37.18 
 
 		 1061 aa  658    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  36.62 
 
 		 1083 aa  669    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  37.48 
 
 		 1051 aa  667    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  36.74 
 
 		 1070 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.212316 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  38.33 
 
 		 1455 aa  696    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00706  cation efflux system protein  37.15 
 
 		 1030 aa  701    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0736219  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3646  heavy metal efflux pump CzcA  37.09 
 
 		 1056 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  36.61 
 
 		 1029 aa  659    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  37.58 
 
 		 1070 aa  675    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  38.31 
 
 		 1077 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  37.29 
 
 		 1069 aa  651    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  37.21 
 
 		 1072 aa  662    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2044  CzcA family heavy metal efflux protein  37.01 
 
 		 1048 aa  643    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.668471  normal  0.474032 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  38.12 
 
 		 1077 aa  686    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  40.81 
 
 		 1050 aa  792    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  37.63 
 
 		 1063 aa  649    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  61.77 
 
 		 1032 aa  1307    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4482  CzcA family heavy metal efflux protein  37.01 
 
 		 1036 aa  705    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  38 
 
 		 1023 aa  656    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  37.69 
 
 		 1043 aa  671    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0018  CzcA family heavy metal efflux protein  38.18 
 
 		 1034 aa  721    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  41.36 
 
 		 1045 aa  815    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  36.65 
 
 		 1039 aa  708    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  39.88 
 
 		 1027 aa  792    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2989  putative cation/heavy metal efflux system protein  41.18 
 
 		 1040 aa  769    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4295  CzcA family heavy metal efflux protein  50.34 
 
 		 1034 aa  1106    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  37.64 
 
 		 1070 aa  675    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  38.12 
 
 		 1077 aa  686    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3469  putative cation efflux system protein  37.66 
 
 		 1083 aa  739    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.806114  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  37.64 
 
 		 1070 aa  675    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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