More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1641 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  100 
 
 		 286 aa  597  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  33.98 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  36.27 
 
 		 255 aa  136  5e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  33.74 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  37.33 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  33.18 
 
 		 290 aa  122  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  31.51 
 
 		 322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  32.59 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  34.07 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  37.43 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  37.21 
 
 		 273 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  30.95 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  34.53 
 
 		 282 aa  115  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  36.63 
 
 		 244 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  32.73 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  36.63 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  34.36 
 
 		 317 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  32.73 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  32.29 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  38.04 
 
 		 299 aa  112  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  29.63 
 
 		 273 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  37.78 
 
 		 269 aa  109  6e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  30.8 
 
 		 316 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  29.24 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  29.48 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  29.24 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  29.66 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  31.42 
 
 		 282 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  31.28 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  31.42 
 
 		 282 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  29.75 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  36.57 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  29.31 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  29.6 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  33.64 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  35.43 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  32.07 
 
 		 276 aa  102  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  39.69 
 
 		 274 aa  102  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  38.3 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  30.47 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  38.41 
 
 		 141 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  42.86 
 
 		 328 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  31.98 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  30.98 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  37.59 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  34.18 
 
 		 279 aa  96.3  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  34.41 
 
 		 319 aa  95.9  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  34.41 
 
 		 321 aa  95.9  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  42.11 
 
 		 232 aa  95.9  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  37.59 
 
 		 296 aa  95.5  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  33.02 
 
 		 286 aa  94.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  30.08 
 
 		 272 aa  93.6  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  46.24 
 
 		 430 aa  92.8  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  37.14 
 
 		 318 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  30.08 
 
 		 285 aa  93.2  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  32.14 
 
 		 278 aa  92.8  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  37.39 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  40.87 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  46 
 
 		 470 aa  90.9  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  44.14 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  41.03 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  44.09 
 
 		 404 aa  90.5  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  33.92 
 
 		 276 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  38.13 
 
 		 402 aa  90.1  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  47.87 
 
 		 465 aa  90.5  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  48.94 
 
 		 429 aa  90.5  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  40 
 
 		 430 aa  89.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  40.6 
 
 		 455 aa  89.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  31.25 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  44.68 
 
 		 440 aa  89.4  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  43.62 
 
 		 498 aa  89.4  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  44.95 
 
 		 331 aa  89  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  44.68 
 
 		 441 aa  89  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  43.24 
 
 		 475 aa  89  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  44.68 
 
 		 440 aa  89  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  31.12 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  48.04 
 
 		 299 aa  88.2  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05623  hypothetical protein  47.31 
 
 		 328 aa  88.2  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  32.73 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  44.09 
 
 		 439 aa  88.2  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  46.94 
 
 		 415 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  42.55 
 
 		 470 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  45.74 
 
 		 353 aa  87  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  43.62 
 
 		 486 aa  87.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  42.31 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  42.86 
 
 		 491 aa  87  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  44.68 
 
 		 419 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  44.68 
 
 		 440 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  43.62 
 
 		 438 aa  86.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  44.68 
 
 		 440 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  44.68 
 
 		 440 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  44.68 
 
 		 440 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  44.68 
 
 		 440 aa  86.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  44.68 
 
 		 440 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  43.62 
 
 		 410 aa  86.7  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  46.81 
 
 		 433 aa  86.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  43.62 
 
 		 438 aa  86.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  44.68 
 
 		 440 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  44.68 
 
 		 440 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  37.84 
 
 		 282 aa  85.9  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>