286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26030 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26030  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 334 aa  636    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0968  Prephenate dehydrogenase  51.82 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0249  prephenate dehydrogenase  44.07 
 
 		 354 aa  189  4e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.524671  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0799  Prephenate dehydrogenase  45.35 
 
 		 329 aa  185  8e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.253718 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0483  prephenate dehydrogenase  35.2 
 
 		 361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0168  prephenate dehydrogenase  42.99 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.538726  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4139  prephenate dehydrogenase  41.03 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.343894  normal  0.0588335 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5343  prephenate dehydrogenase  37.05 
 
 		 332 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5050  prephenate dehydrogenase  37.05 
 
 		 332 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4962  prephenate dehydrogenase  36.75 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308401  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3757  prephenate dehydrogenase  44.35 
 
 		 361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.673917  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13786  prephenate dehydrogenase  38.71 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.791887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0236  Prephenate dehydrogenase  44 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36910  prephenate dehydrogenase  44.73 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0782999 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0466  Prephenate dehydrogenase  44.57 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.614226  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1212  prephenate dehydrogenase  38.03 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.827546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0308  Prephenate dehydrogenase  43.75 
 
 		 325 aa  129  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4050  Prephenate dehydrogenase  38.36 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5596  prephenate dehydrogenase  37.38 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  39.22 
 
 		 364 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  29.58 
 
 		 365 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  39.01 
 
 		 746 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  37.23 
 
 		 367 aa  119  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.65 
 
 		 735 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  41.99 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  31.4 
 
 		 369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  37.6 
 
 		 379 aa  116  5e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  37.22 
 
 		 534 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.94 
 
 		 746 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.21 
 
 		 746 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  38.35 
 
 		 535 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  39.04 
 
 		 288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.02 
 
 		 746 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  37.46 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.44 
 
 		 742 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  37.55 
 
 		 370 aa  109  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.64 
 
 		 746 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  31.11 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.14 
 
 		 746 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  34.21 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  34.21 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  27.42 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.22 
 
 		 746 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0659  prephenate dehydrogenase  28.4 
 
 		 276 aa  106  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.773166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  35.4 
 
 		 286 aa  106  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  38.33 
 
 		 286 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1331  Prephenate dehydrogenase  36.12 
 
 		 390 aa  105  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.762233  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  38.85 
 
 		 388 aa  105  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  37.78 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  31.6 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  32.16 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.14 
 
 		 752 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  32.35 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  33.21 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  33.21 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.94 
 
 		 750 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  35.85 
 
 		 364 aa  102  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1535  prephenate dehydrogenase  33.8 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000209792 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  37.55 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3393  Prephenate dehydrogenase  29.92 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  32.75 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  35.61 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0385  arogenate dehydrogenase  36.13 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.94056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  36.64 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1535  prephenate dehydrogenase  32.75 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0206592  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.56 
 
 		 301 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  35.5 
 
 		 287 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  35.59 
 
 		 339 aa  99.8  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  31.95 
 
 		 322 aa  99.4  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  31.85 
 
 		 334 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4722  prephenate dehydrogenase  34.69 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  27.64 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17561  arogenate dehydrogenase  32.32 
 
 		 279 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  33.72 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  33.17 
 
 		 278 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2019  Prephenate dehydrogenase  31.67 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  32.5 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.27 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  35.09 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  30.63 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  32.69 
 
 		 278 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  35.04 
 
 		 290 aa  97.1  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  33.45 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.39 
 
 		 313 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1657  arogenate dehydrogenase  31.71 
 
 		 279 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1162  prephenate dehydrogenase  35 
 
 		 286 aa  96.7  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3283  prephenate dehydrogenase  36.95 
 
 		 298 aa  96.3  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0269718  normal  0.62503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.67 
 
 		 312 aa  96.3  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17521  arogenate dehydrogenase  28.72 
 
 		 279 aa  95.9  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22941  arogenate dehydrogenase  38.18 
 
 		 314 aa  95.9  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17721  arogenate dehydrogenase  30.49 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  32.46 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  30.53 
 
 		 367 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1638  Prephenate dehydrogenase  36.21 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  35.74 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.22 
 
 		 310 aa  95.1  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  34.35 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4397  arogenate dehydrogenase  33.51 
 
 		 284 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229138  hitchhiker  0.0000184997 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.65 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  28 
 
 		 368 aa  94  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>