More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3426 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3426  HAD family hydrolase  100 
 
 		 203 aa  418  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0526  HAD family hydrolase  98.03 
 
 		 210 aa  410  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3600  HAD family hydrolase  96.41 
 
 		 206 aa  391  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4039  HAD superfamily hydrolase  92.23 
 
 		 202 aa  371  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  75.77 
 
 		 204 aa  313  9e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  74.87 
 
 		 204 aa  308  4e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  74.87 
 
 		 204 aa  308  5e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  73.85 
 
 		 204 aa  307  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  74.36 
 
 		 204 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0371  HAD family hydrolase  56.91 
 
 		 205 aa  232  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0499  HAD superfamily hydrolase  52.88 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  43.16 
 
 		 209 aa  145  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0523  hydrolase, HAD-family protein  37.17 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0171673  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  41.1 
 
 		 172 aa  137  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  40 
 
 		 214 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001470  HAD-superfamily hydrolase  34.69 
 
 		 206 aa  125  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  38.55 
 
 		 201 aa  123  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05409  phosphoglycolate phosphatase  36.88 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  34.59 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2257  HAD family hydrolase  42.95 
 
 		 207 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12890  hypothetical protein  37.56 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753603  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1167  hypothetical protein  37.56 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0694  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4773  HAD family hydrolase  36.69 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  35.96 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.05 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29989  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  37.43 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3718  HAD family hydrolase  39.41 
 
 		 197 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3457  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.66 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.51 
 
 		 204 aa  95.1  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4915  HAD family hydrolase  36.21 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000596857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2814  HAD family hydrolase  39.75 
 
 		 202 aa  92  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.2 
 
 		 198 aa  92  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4761  HAD superfamily hydrolase  35.63 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000261111  hitchhiker  0.00232434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4635  HAD family hydrolase  35.63 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262111  hitchhiker  0.00233323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3448  HAD family hydrolase  34.16 
 
 		 209 aa  89  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  36.14 
 
 		 204 aa  88.2  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4659  HAD-superfamily hydrolase  34.5 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5811  predicted protein  30.46 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695872  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87850  predicted protein  32.28 
 
 		 227 aa  72  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.762716  normal  0.0707375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  26.78 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  26.78 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  24.75 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.58 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.423006  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  26.23 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  30.43 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  31.71 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  31.71 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2061  HAD family hydrolase  27.62 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0183643  unclonable  0.0000224709 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  23.74 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2406  HAD family hydrolase  28.96 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0211635  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  24.59 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2289  HAD family hydrolase  28.96 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000247556  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2056  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.96 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0324232  unclonable  0.00000000000163854 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1970  HAD family hydrolase  27.62 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000840588  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  24.73 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1917  HAD family hydrolase  27.14 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0123365  hitchhiker  0.0000000762533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  26.23 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  29.78 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2414  phosphoglycolate phosphatase, putative  28.49 
 
 		 229 aa  62  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04278  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1 and 3  31.17 
 
 		 185 aa  62  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  28.04 
 
 		 234 aa  62  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2060  HAD family hydrolase  28.42 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00381556  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2072  HAD family hydrolase  27.03 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000098787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  23.85 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1710  HAD family hydrolase  27.22 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2235  phosphoglycolate phosphatase 2  27.32 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  29.51 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  26.51 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  29.79 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3540  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.14 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0546  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.93 
 
 		 319 aa  58.5  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  23.36 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  31.12 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  26.06 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  30.24 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3208  hydrolase  23.89 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2065  HAD family hydrolase  27.22 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0943577  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1688  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  31.25 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168366  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  28.27 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  26.63 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  28.27 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1666  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.16 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.695428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  28.27 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  28.27 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  28.27 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  28.26 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  27.85 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  25.53 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.768725 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  27.85 
 
 		 252 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  27.85 
 
 		 252 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  27.85 
 
 		 252 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0135  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.53 
 
 		 272 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.292 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  24.29 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  25.53 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  31.46 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.81 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2151  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  27.53 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>