136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0921 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0921  ApbE family protein, putative  100 
 
 		 282 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0949043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0957  ApbE family protein, putative  98.93 
 
 		 282 aa  566  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.76647  normal  0.566735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0922  ApbE family protein, putative  98.22 
 
 		 282 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767638  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1090  ApbE family protein, putative  79.5 
 
 		 279 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3580  ApbE family protein, putative  78.93 
 
 		 281 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0906  ApbE family protein, putative  78.93 
 
 		 281 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00687299  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3383  ApbE family lipoprotein  78.93 
 
 		 281 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3457  ApbE family protein, putative  78.93 
 
 		 281 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000973965  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2657  ApbE family protein, putative  43.42 
 
 		 273 aa  209  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00549568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0416  ApbE-like lipoprotein  38.67 
 
 		 277 aa  172  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00253803  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0708  thiamine biosynthesis lipoprotein apbE precursor transmembrane  40.88 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.314159  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1800  ApbE family lipoprotein  37.14 
 
 		 279 aa  145  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000665627  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1180  ApbE-like lipoprotein  34.34 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5381  ApbE family lipoprotein  35.82 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1846  ApbE family lipoprotein  35.82 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000243371 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1565  ApbE family lipoprotein  32.05 
 
 		 277 aa  119  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0611  thiamine biosynthesis lipoprotein apbE precursor transmembrane  38.92 
 
 		 298 aa  99.4  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2627  putative thiamine biosynthesis lipoprotein APBE transmembrane  35.81 
 
 		 292 aa  92.4  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0956093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3433  ApbE family lipoprotein  34.97 
 
 		 287 aa  91.3  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1886  ApbE family lipoprotein  33.79 
 
 		 259 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00789462  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1557  ApbE family lipoprotein  34.06 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.232124 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2601  ApbE family lipoprotein  30.99 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  29.94 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  21.76 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  28.17 
 
 		 368 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  28.17 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  26.21 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.65 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  29.41 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  27.78 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  32.09 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  30.37 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  29.17 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  24.87 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  31.25 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  33.94 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  27.47 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  28.89 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.6 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  25.56 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  27.91 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  29.81 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  28.66 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  27.17 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  27.24 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  29.81 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  25.48 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  28.19 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.17 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  25.32 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  34.48 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  27.76 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  29.11 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  29.58 
 
 		 336 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  30.25 
 
 		 335 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  33.79 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1758  ApbE family lipoprotein  32.08 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  26.06 
 
 		 329 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  25.79 
 
 		 355 aa  53.1  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4341  ApbE family lipoprotein  28.29 
 
 		 336 aa  53.1  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  22.17 
 
 		 342 aa  52.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  29.01 
 
 		 353 aa  52.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1835  ApbE family lipoprotein  33.57 
 
 		 310 aa  52.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.08 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  28.26 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3618  ApbE family lipoprotein  31.91 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128321  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  29.38 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  23.44 
 
 		 343 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  29.7 
 
 		 345 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  30.41 
 
 		 321 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5164  ApbE-like lipoprotein  30.34 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  31.44 
 
 		 339 aa  50.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3099  ApbE family lipoprotein  31.9 
 
 		 320 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.19 
 
 		 337 aa  49.7  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0433  twin-arginine translocation pathway signal  27.67 
 
 		 333 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3394  ApbE family lipoprotein  29.7 
 
 		 315 aa  49.3  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  28.95 
 
 		 341 aa  49.3  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  27.7 
 
 		 362 aa  49.3  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0574  ApbE-like lipoprotein  27.2 
 
 		 279 aa  49.3  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.963363  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  29.8 
 
 		 344 aa  48.9  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3168  ApbE family lipoprotein  26.4 
 
 		 313 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0984  ApbE family lipoprotein  26.83 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  27.08 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  27.08 
 
 		 352 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  30.71 
 
 		 347 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  33.74 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3326  hypothetical protein  31.21 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128315 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  34.75 
 
 		 304 aa  46.6  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  30.48 
 
 		 340 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.33 
 
 		 320 aa  46.6  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  26.17 
 
 		 302 aa  46.2  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1691  ApbE family lipoprotein  25.12 
 
 		 338 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  26.29 
 
 		 374 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  27.51 
 
 		 340 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5388  ApbE-like lipoprotein  27.27 
 
 		 329 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  26.29 
 
 		 374 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  32.87 
 
 		 386 aa  45.8  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2150  ApbE family lipoprotein  25.57 
 
 		 332 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  0.0417056 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  27.27 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>