229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2586 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  73.73 
 
 		 424 aa  665    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  64.06 
 
 		 1021 aa  1341    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  38.71 
 
 		 988 aa  649    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  63 
 
 		 1024 aa  1287    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  63.57 
 
 		 1024 aa  1283    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  63.56 
 
 		 1029 aa  1317    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  39.42 
 
 		 1020 aa  689    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  65.68 
 
 		 1010 aa  1393    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  40.66 
 
 		 1005 aa  692    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  64.18 
 
 		 1024 aa  1294    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  55.83 
 
 		 1018 aa  1115    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  39.25 
 
 		 1010 aa  676    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  63.14 
 
 		 1029 aa  1317    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  64.83 
 
 		 839 aa  1098    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  65.09 
 
 		 763 aa  1004    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  100 
 
 		 1046 aa  2169    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  65.48 
 
 		 1024 aa  1348    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  62.63 
 
 		 1029 aa  1309    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  46.38 
 
 		 908 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  28.81 
 
 		 1498 aa  386  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  47.46 
 
 		 461 aa  351  3e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  43.01 
 
 		 441 aa  312  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2849  amidohydrolase  61.11 
 
 		 234 aa  257  8e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00752836  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  34.46 
 
 		 470 aa  250  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  36.16 
 
 		 460 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  37.86 
 
 		 464 aa  243  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  36.67 
 
 		 469 aa  240  8e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  34.75 
 
 		 471 aa  239  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  35.28 
 
 		 475 aa  237  8e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  34.56 
 
 		 525 aa  226  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  32.68 
 
 		 560 aa  222  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1509  amidohydrolase  59.06 
 
 		 187 aa  221  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00999968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  30.65 
 
 		 388 aa  194  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  34.26 
 
 		 386 aa  191  5e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  31.41 
 
 		 386 aa  184  7e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  31.41 
 
 		 384 aa  184  8.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  31.83 
 
 		 385 aa  182  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  31.83 
 
 		 385 aa  181  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  30.89 
 
 		 379 aa  177  9e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  31.84 
 
 		 402 aa  174  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  31.95 
 
 		 397 aa  171  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  29.8 
 
 		 429 aa  170  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  30.28 
 
 		 396 aa  165  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  29.35 
 
 		 389 aa  164  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  30.29 
 
 		 384 aa  162  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  31.83 
 
 		 402 aa  161  7e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  29.7 
 
 		 385 aa  159  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  29.1 
 
 		 420 aa  157  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  29.28 
 
 		 389 aa  155  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  29.05 
 
 		 412 aa  154  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  32.11 
 
 		 390 aa  152  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  30.15 
 
 		 407 aa  153  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  29.15 
 
 		 384 aa  152  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  29.32 
 
 		 385 aa  152  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  30.56 
 
 		 386 aa  152  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  27.97 
 
 		 383 aa  152  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  29.43 
 
 		 385 aa  150  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  31.85 
 
 		 388 aa  149  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  30.93 
 
 		 403 aa  149  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  28.89 
 
 		 386 aa  147  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  28.08 
 
 		 424 aa  144  9e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  29.46 
 
 		 403 aa  144  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  27.56 
 
 		 382 aa  141  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  27.21 
 
 		 396 aa  140  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  28.46 
 
 		 387 aa  137  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  30.11 
 
 		 376 aa  135  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  26.63 
 
 		 400 aa  134  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  30.11 
 
 		 373 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  29.52 
 
 		 376 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  30.11 
 
 		 376 aa  132  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  29.52 
 
 		 376 aa  131  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  29.26 
 
 		 376 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  28.75 
 
 		 376 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  29.26 
 
 		 376 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  29.26 
 
 		 376 aa  130  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  29.26 
 
 		 376 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  29.26 
 
 		 376 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  26.76 
 
 		 392 aa  127  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  27.79 
 
 		 381 aa  124  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  27.45 
 
 		 443 aa  119  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  26.98 
 
 		 401 aa  115  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  23.81 
 
 		 582 aa  112  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  24.56 
 
 		 429 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  25.3 
 
 		 444 aa  93.6  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  27.19 
 
 		 428 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  23.11 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  24.71 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  26.3 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  25.58 
 
 		 419 aa  79.7  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  25.17 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  23.43 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  24.73 
 
 		 448 aa  77  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  23.87 
 
 		 424 aa  76.6  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  26.22 
 
 		 429 aa  77  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  25.75 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  24.16 
 
 		 439 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  24.78 
 
 		 448 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  23.8 
 
 		 1062 aa  72  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  26.32 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  24.32 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>