More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0123 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 153 aa  305  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  45.95 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1117  lipoprotein signal peptidase  44.9 
 
 		 165 aa  124  7e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.149841  normal  0.0706096 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  43.66 
 
 		 161 aa  122  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  43.92 
 
 		 178 aa  121  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  42.86 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  39.46 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  43.42 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  48.3 
 
 		 164 aa  116  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  43.14 
 
 		 166 aa  116  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  45.52 
 
 		 172 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  43.84 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  41.22 
 
 		 174 aa  111  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  45.52 
 
 		 172 aa  110  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  43.45 
 
 		 166 aa  110  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  42.14 
 
 		 164 aa  110  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  49.29 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 		 163 aa  110  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  40.54 
 
 		 165 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  41.43 
 
 		 178 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  47.97 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  40.56 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 166 aa  107  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  38.78 
 
 		 173 aa  107  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  45.71 
 
 		 174 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  45 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  43.97 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  43.97 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  43.06 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  43.97 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  43.97 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  43.97 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  43.97 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  46.26 
 
 		 358 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  43.97 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  45.71 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  43.97 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 		 182 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  40.82 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  43.33 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  40.67 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  43.8 
 
 		 166 aa  104  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  46.31 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 176 aa  103  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  44.53 
 
 		 164 aa  103  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  45 
 
 		 168 aa  103  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  41.56 
 
 		 159 aa  103  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  46.81 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  46.81 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  43.14 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  38.78 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  45.07 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  41.55 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 		 179 aa  101  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  42.55 
 
 		 166 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  42.55 
 
 		 166 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  42.55 
 
 		 166 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  46.72 
 
 		 178 aa  100  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  41.84 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  41.84 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  44.22 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  42.28 
 
 		 364 aa  99.4  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  42.55 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  41.84 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 		 169 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 171 aa  98.6  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  44.68 
 
 		 182 aa  98.6  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 		 169 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  45.14 
 
 		 171 aa  98.2  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  41.35 
 
 		 164 aa  97.4  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 163 aa  97.4  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  40.27 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 165 aa  97.4  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1577  lipoprotein signal peptidase  43.61 
 
 		 167 aa  97.1  8e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1520  lipoprotein signal peptidase  43.61 
 
 		 167 aa  97.1  8e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0161435  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  44 
 
 		 189 aa  97.1  8e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 		 166 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  40.91 
 
 		 166 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  42.57 
 
 		 357 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  38.97 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 163 aa  95.5  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  41.89 
 
 		 165 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  42.25 
 
 		 165 aa  96.3  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  41.43 
 
 		 163 aa  95.5  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  40.82 
 
 		 162 aa  95.5  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  41.61 
 
 		 359 aa  95.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  41.61 
 
 		 359 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  41.55 
 
 		 176 aa  94.7  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3614  lipoprotein signal peptidase  42.75 
 
 		 157 aa  94.4  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.463393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3952  lipoprotein signal peptidase  42.75 
 
 		 157 aa  94.4  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.386002  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  41.38 
 
 		 170 aa  94  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  40.71 
 
 		 176 aa  94  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  39.46 
 
 		 178 aa  94  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  43.28 
 
 		 167 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>