64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1311 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  100 
 
 		 240 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  74.06 
 
 		 240 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  72.92 
 
 		 240 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  72.5 
 
 		 240 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  72.08 
 
 		 240 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  72.92 
 
 		 240 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  57.32 
 
 		 244 aa  290  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  49.37 
 
 		 242 aa  255  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  45.38 
 
 		 243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  45.19 
 
 		 240 aa  207  8e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  41.42 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  42.37 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  41.15 
 
 		 242 aa  186  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  41.53 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  40.09 
 
 		 238 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  36.02 
 
 		 241 aa  158  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  35 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  36.97 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  36.91 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  30.96 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  31.02 
 
 		 257 aa  121  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  31.68 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  31.51 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  29.18 
 
 		 256 aa  108  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  28.63 
 
 		 244 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  30.29 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  33.33 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  29.82 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  25.42 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  30.28 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  25.21 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  30.73 
 
 		 229 aa  99  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  27.53 
 
 		 245 aa  98.2  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  27.43 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  28.57 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  29.65 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  33.51 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  30.04 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  31.96 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  27.62 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  26.24 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  25.78 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  29.29 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  28.02 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  31.54 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  24.79 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  26.96 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  23.08 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  25.96 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  27.32 
 
 		 264 aa  65.1  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  25.11 
 
 		 461 aa  65.1  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  27.72 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  29.44 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  26.89 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  26.64 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  28.21 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  27.78 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  26.79 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  26.13 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  27.08 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  26.46 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  26.47 
 
 		 255 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  23.94 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  25.77 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>