More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1341 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1341  endonuclease III  100 
 
 		 213 aa  442  1e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0516  endonuclease III/Nth  65.26 
 
 		 228 aa  299  2e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0512  endonuclease III  68.97 
 
 		 210 aa  286  2e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1222  endonuclease III  68.47 
 
 		 212 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0698  endonuclease III  70.41 
 
 		 208 aa  281  4.0000000000000003e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1074  endonuclease III  70.41 
 
 		 208 aa  281  4.0000000000000003e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.497275  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0915  endonuclease III  70.41 
 
 		 208 aa  278  5e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.603627  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0623  endonuclease III  69.9 
 
 		 208 aa  276  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.668418  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0115  endonuclease III  64.04 
 
 		 211 aa  265  4e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  51.03 
 
 		 215 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1159  endonuclease III  48.99 
 
 		 215 aa  181  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3556  endonuclease III  46.77 
 
 		 225 aa  181  9.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.848548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  47.94 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0620  hypothetical protein  46.81 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  40.95 
 
 		 235 aa  171  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3695  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.19 
 
 		 218 aa  171  5.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  40.28 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1772  endonuclease III  43.2 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  46.67 
 
 		 220 aa  168  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  42.58 
 
 		 219 aa  167  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.86 
 
 		 219 aa  167  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  42.11 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  43.08 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  41.24 
 
 		 234 aa  165  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  39.71 
 
 		 285 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08500  endonuclease III  41.98 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.479508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  41.33 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  43.16 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  40.74 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  41.43 
 
 		 234 aa  161  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  41.27 
 
 		 281 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0198  endonuclease III  38.03 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1491  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.69 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000021977  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1838  endonuclease III  45.9 
 
 		 267 aa  157  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.749072  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  46.45 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0150  endonuclease III  39.11 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  43.98 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  38.39 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  39.58 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  43.09 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0613  endonuclease III  41.27 
 
 		 286 aa  152  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  38.42 
 
 		 222 aa  151  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.08 
 
 		 214 aa  151  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3269  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40.53 
 
 		 217 aa  151  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.398571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  36.41 
 
 		 216 aa  151  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  38.32 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  39.9 
 
 		 219 aa  149  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  39.15 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  42.33 
 
 		 223 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  41.05 
 
 		 223 aa  149  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1638  endonuclease III  37.5 
 
 		 228 aa  149  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.104677  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  38.07 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  38.83 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26220  endonuclease III  41.15 
 
 		 230 aa  149  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.420808  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  38.32 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  38.83 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  37.76 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  38.94 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  39.69 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  38.83 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  39.11 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  38.61 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  43.32 
 
 		 225 aa  148  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1364  endonuclease III  40.31 
 
 		 230 aa  147  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.621669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0954  endonuclease III  38.92 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  37.75 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  40.74 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  39.34 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  40.74 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  40.74 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  40.74 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  39.11 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  40.74 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  40.74 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  40.74 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  40.21 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0789  endonuclease III  40.59 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0549  endonuclease III  36.23 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0850765 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  40.74 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0123  endonuclease III  39.47 
 
 		 223 aa  145  3e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000215731  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0857  endonuclease III  39.58 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  40.74 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  38.07 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  40.21 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5316  endonuclease III  38.34 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  39.6 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  35.78 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  40 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  40.5 
 
 		 213 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0144  endonuclease III  37.5 
 
 		 229 aa  144  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  35.47 
 
 		 277 aa  144  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2604  endonuclease III  35.35 
 
 		 227 aa  144  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.324373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0235  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.93 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.784957  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  39.32 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0197  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40.93 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000114708  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2747  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.32 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81262  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0851  endonuclease III  41.62 
 
 		 231 aa  143  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.92 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0203  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.92 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.419558  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>