More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0851 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0851  endonuclease III  100 
 
 		 231 aa  476  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0829  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  96.1 
 
 		 231 aa  463  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.141999  normal  0.027211 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0880  endonuclease III  85.71 
 
 		 231 aa  421  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000630803  hitchhiker  0.000000662064 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  72 
 
 		 210 aa  301  6.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273588  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  71.5 
 
 		 212 aa  291  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  71 
 
 		 212 aa  291  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  65.38 
 
 		 211 aa  282  3.0000000000000004e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  68.32 
 
 		 213 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  63.59 
 
 		 236 aa  281  6.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  69 
 
 		 212 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  68.5 
 
 		 212 aa  280  9e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  68 
 
 		 215 aa  280  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1539  endonuclease III  68.84 
 
 		 211 aa  279  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  65 
 
 		 230 aa  279  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19210  endonuclease III/Nth  67.82 
 
 		 212 aa  279  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  64.36 
 
 		 219 aa  278  4e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  62.27 
 
 		 228 aa  278  5e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  61.82 
 
 		 228 aa  277  9e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  65.02 
 
 		 219 aa  277  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  65.02 
 
 		 219 aa  277  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0732  endonuclease III  68.81 
 
 		 211 aa  276  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  67 
 
 		 212 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  68.78 
 
 		 211 aa  275  3e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  65.84 
 
 		 225 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  66 
 
 		 335 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  66 
 
 		 212 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  69.84 
 
 		 211 aa  274  8e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  66.5 
 
 		 213 aa  274  9e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  65.5 
 
 		 212 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  65.5 
 
 		 212 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1721  endonuclease III  69.84 
 
 		 211 aa  272  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1563  endonuclease III  69.84 
 
 		 211 aa  272  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1551  endonuclease III  69.84 
 
 		 211 aa  272  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1623  endonuclease III  69.84 
 
 		 211 aa  272  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal  0.347988 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1815  endonuclease III  69.84 
 
 		 211 aa  272  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  decreased coverage  0.000297282 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  63.33 
 
 		 210 aa  271  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1889  endonuclease III  69.31 
 
 		 211 aa  271  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2345  endonuclease III  68.78 
 
 		 211 aa  271  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  67.01 
 
 		 211 aa  271  5.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1074  endonuclease III  63.37 
 
 		 235 aa  271  5.000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2517  endonuclease III  62.02 
 
 		 216 aa  271  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  68.25 
 
 		 211 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  68.25 
 
 		 211 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  68.25 
 
 		 211 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  68.25 
 
 		 211 aa  270  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  68.25 
 
 		 211 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  68.25 
 
 		 211 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3170  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  61.54 
 
 		 216 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  68.25 
 
 		 211 aa  270  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  68.25 
 
 		 211 aa  270  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2971  endonuclease III  67.89 
 
 		 210 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  64.5 
 
 		 212 aa  268  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  62.14 
 
 		 236 aa  268  5e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  65.5 
 
 		 212 aa  268  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0463  endonuclease III  62.38 
 
 		 226 aa  268  5e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0687351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2038  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  67.72 
 
 		 212 aa  267  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0305  endonuclease III  60.58 
 
 		 218 aa  266  2e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  62.38 
 
 		 215 aa  266  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  64.36 
 
 		 213 aa  266  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1869  endonuclease III  67.89 
 
 		 210 aa  266  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1886  endonuclease III  60.58 
 
 		 218 aa  266  2e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  64 
 
 		 213 aa  266  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1866  endonuclease III  64.5 
 
 		 211 aa  266  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2160  endonuclease III  67.37 
 
 		 211 aa  265  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1901  endonuclease III  68.25 
 
 		 213 aa  265  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000183349  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2013  endonuclease III  68.25 
 
 		 213 aa  265  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000346358  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2122  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  63 
 
 		 212 aa  265  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134945  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2247  endonuclease III  68.25 
 
 		 213 aa  265  4e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000650328  normal  0.36112 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4551  hypothetical protein  66.84 
 
 		 213 aa  265  5e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2265  endonuclease III  66.84 
 
 		 213 aa  265  5e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000635696  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2279  endonuclease III  66.84 
 
 		 213 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0342815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1922  endonuclease III  66.67 
 
 		 211 aa  265  5.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1844  endonuclease III  66.32 
 
 		 213 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000031535  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1562  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  61.27 
 
 		 226 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888667 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2234  endonuclease III  67.89 
 
 		 213 aa  264  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219145 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2059  endonuclease III  66.84 
 
 		 213 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000403968  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2106  endonuclease III  66.84 
 
 		 213 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0792284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  62.07 
 
 		 214 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2070  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  66.32 
 
 		 213 aa  263  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.027671  normal  0.855553 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  62.02 
 
 		 214 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02970  endonuclease III  63.96 
 
 		 217 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2747  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  62.02 
 
 		 212 aa  262  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81262  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2824  endonuclease III  58.3 
 
 		 250 aa  262  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1905  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  65.79 
 
 		 213 aa  262  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  61.88 
 
 		 214 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2562  endonuclease III  65.61 
 
 		 212 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2514  endonuclease III  65.61 
 
 		 231 aa  260  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1005  endonuclease III protein  61.39 
 
 		 214 aa  259  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248668  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  61.39 
 
 		 214 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  61.39 
 
 		 214 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2655  endonuclease III  60.1 
 
 		 212 aa  259  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  61.06 
 
 		 213 aa  259  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  60.89 
 
 		 214 aa  258  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2297  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  60.58 
 
 		 212 aa  258  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  59.13 
 
 		 213 aa  258  6e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  60.89 
 
 		 214 aa  257  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  58.65 
 
 		 211 aa  257  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0724  endonuclease III  61.5 
 
 		 213 aa  257  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155914  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  60.89 
 
 		 214 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2072  endonuclease III  65.26 
 
 		 213 aa  256  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>