110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2064 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2064  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  751    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00393707  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  40.74 
 
 		 137 aa  96.7  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1878  hypothetical protein  37.04 
 
 		 137 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  44.79 
 
 		 99 aa  80.1  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1890  hypothetical protein  36.84 
 
 		 136 aa  74.3  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1879  hypothetical protein  34.21 
 
 		 137 aa  73.9  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0864  peptidase S49, protease IV  37.04 
 
 		 139 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  30.88 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  35.44 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  33.01 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  30.99 
 
 		 138 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  34.04 
 
 		 160 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  31.85 
 
 		 169 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  28.74 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2773  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.00177e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  36.94 
 
 		 170 aa  60.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  30.16 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  28.05 
 
 		 178 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0656  general secretion pathway protein H  25.44 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  31.65 
 
 		 136 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3289  putative type IV fimbrial pilin protein  30.89 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  33.33 
 
 		 173 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  29.92 
 
 		 137 aa  57  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  31.13 
 
 		 198 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  25.53 
 
 		 198 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  31.13 
 
 		 198 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  25.53 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  25.53 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  32.52 
 
 		 138 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  32.08 
 
 		 198 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  26.95 
 
 		 173 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  35.07 
 
 		 174 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  44.93 
 
 		 168 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0230  Fimbrial protein pilin  36.84 
 
 		 161 aa  54.3  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  24.83 
 
 		 170 aa  54.3  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  34.58 
 
 		 162 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  32.52 
 
 		 171 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  26.53 
 
 		 168 aa  53.5  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0627  putative major pilin subunit  26.12 
 
 		 147 aa  53.5  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  42.86 
 
 		 133 aa  53.5  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  51.06 
 
 		 165 aa  53.1  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  33.33 
 
 		 163 aa  53.1  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0446  putative type IV fimbrial pilin protein  31.43 
 
 		 205 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  31.16 
 
 		 133 aa  53.1  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0289  hypothetical protein  32.38 
 
 		 118 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0163105 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  47.92 
 
 		 169 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  33.59 
 
 		 152 aa  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0473  fimbrial protein pilin  29.86 
 
 		 139 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  34.94 
 
 		 107 aa  50.8  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  39.34 
 
 		 107 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  31.43 
 
 		 139 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  40.98 
 
 		 179 aa  50.1  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  31.19 
 
 		 111 aa  49.7  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  26.34 
 
 		 196 aa  50.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  36.07 
 
 		 107 aa  49.7  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04886  pilin  30.25 
 
 		 141 aa  49.7  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.969324  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4781  Tfp pilus assembly protein  24.84 
 
 		 159 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1757  hypothetical protein  36.51 
 
 		 166 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  26.88 
 
 		 174 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3155  hypothetical protein  39.44 
 
 		 172 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  43.64 
 
 		 167 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  33.96 
 
 		 144 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3782  methylation site containing protein  35.25 
 
 		 148 aa  47  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  27.63 
 
 		 182 aa  46.6  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0797  pilin  32.12 
 
 		 148 aa  47  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  39.29 
 
 		 162 aa  46.6  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  31.91 
 
 		 360 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  54.05 
 
 		 139 aa  46.2  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  24.52 
 
 		 179 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1866  hypothetical protein  40 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.287595  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0666  putative major pilin subunit  25 
 
 		 147 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3386  hypothetical protein  40 
 
 		 438 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  27.74 
 
 		 134 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  32.17 
 
 		 145 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  32.17 
 
 		 145 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  32.17 
 
 		 145 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  32.17 
 
 		 145 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  41.3 
 
 		 138 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0278  type IV pilin, putative  29.1 
 
 		 172 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0979  PilA  29.1 
 
 		 207 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  24.03 
 
 		 148 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0975  TM2 domain containing protein  33.33 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  63.33 
 
 		 166 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  63.33 
 
 		 169 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2678  putative type IV pilin  29.1 
 
 		 189 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2398  putative type IV pilin  29.1 
 
 		 207 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0816  putative type IV pilin protein PilA  29.1 
 
 		 172 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0820  putative type IV pilin protein PilA  29.1 
 
 		 172 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0011  putative type IV pilin  29.1 
 
 		 189 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  37.97 
 
 		 109 aa  44.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  38.6 
 
 		 142 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0948  TM2 domain containing protein  33.33 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0649  pilin family protein  28.47 
 
 		 207 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0660  hypothetical protein  29.45 
 
 		 128 aa  44.3  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  24.8 
 
 		 141 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  31.58 
 
 		 145 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  33.33 
 
 		 166 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  51.35 
 
 		 141 aa  43.9  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  34.91 
 
 		 167 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  42.86 
 
 		 134 aa  43.5  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>