224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2174 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  54.55 
 
 
988 aa  1080    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  54.55 
 
 
988 aa  1080    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  55.01 
 
 
989 aa  1100    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  39.72 
 
 
983 aa  678    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  41.63 
 
 
996 aa  752    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  86.82 
 
 
994 aa  1807    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  41.3 
 
 
992 aa  810    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  54.2 
 
 
1015 aa  1053    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  40.99 
 
 
992 aa  697    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  55.88 
 
 
990 aa  1107    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  55.76 
 
 
988 aa  1097    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  53.55 
 
 
985 aa  1032    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  53.4 
 
 
988 aa  1035    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  55.17 
 
 
990 aa  1093    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  55.13 
 
 
988 aa  1093    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  55.13 
 
 
989 aa  1101    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  37.08 
 
 
988 aa  652    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  60.19 
 
 
755 aa  930    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  55.13 
 
 
988 aa  1093    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  55.13 
 
 
988 aa  1093    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  55.33 
 
 
988 aa  1089    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  40.99 
 
 
992 aa  697    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  41.59 
 
 
996 aa  746    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  55.16 
 
 
988 aa  1093    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  49.95 
 
 
988 aa  950    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  49.95 
 
 
988 aa  950    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  49.95 
 
 
988 aa  950    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  54.96 
 
 
988 aa  1096    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  55.03 
 
 
964 aa  1084    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  60.93 
 
 
606 aa  718    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  46.47 
 
 
731 aa  679    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  55.27 
 
 
990 aa  1095    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  55.27 
 
 
990 aa  1095    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  55.27 
 
 
990 aa  1095    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  41.59 
 
 
996 aa  746    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  52.89 
 
 
988 aa  1033    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  52.89 
 
 
988 aa  1033    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  55.27 
 
 
990 aa  1095    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  55.13 
 
 
988 aa  1093    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  41.59 
 
 
996 aa  746    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  39.6 
 
 
987 aa  697    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  53.1 
 
 
988 aa  1028    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  55.23 
 
 
988 aa  1097    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  99.9 
 
 
994 aa  2056    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  99.82 
 
 
550 aa  1144    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2083  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
440 aa  907    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
994 aa  2058    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
862 aa  1779    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  55.88 
 
 
990 aa  1107    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  37.69 
 
 
988 aa  610  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  37.69 
 
 
988 aa  610  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  36.21 
 
 
961 aa  581  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  34.52 
 
 
991 aa  580  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  34.52 
 
 
991 aa  580  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  33.23 
 
 
991 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  34.01 
 
 
999 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  34.3 
 
 
983 aa  560  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  34.45 
 
 
877 aa  478  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  36.57 
 
 
772 aa  468  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  45.63 
 
 
526 aa  466  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0358  transposase Tn3 family protein  81.58 
 
 
273 aa  458  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  44.73 
 
 
546 aa  416  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  31.01 
 
 
1006 aa  411  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  67.73 
 
 
310 aa  396  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  65.64 
 
 
305 aa  396  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  31.59 
 
 
738 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  40.69 
 
 
573 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  29.9 
 
 
997 aa  379  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  31.1 
 
 
968 aa  366  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  68.92 
 
 
255 aa  359  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  30.67 
 
 
976 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  48.24 
 
 
371 aa  346  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  31.19 
 
 
924 aa  345  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  79.81 
 
 
224 aa  340  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  49.55 
 
 
338 aa  336  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  32.95 
 
 
612 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  31.24 
 
 
613 aa  326  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  28.07 
 
 
1028 aa  311  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  28.56 
 
 
991 aa  310  8e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  28.56 
 
 
991 aa  310  8e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  27.67 
 
 
1075 aa  288  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0197  transposase  30.86 
 
 
523 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  27.13 
 
 
1029 aa  283  8.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  32.87 
 
 
771 aa  283  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  25.52 
 
 
986 aa  281  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  68.23 
 
 
203 aa  273  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  51.22 
 
 
246 aa  266  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  50.81 
 
 
246 aa  265  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  35.93 
 
 
435 aa  257  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  25.83 
 
 
994 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  24.16 
 
 
990 aa  254  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  70 
 
 
339 aa  251  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  25.16 
 
 
999 aa  242  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  25.16 
 
 
999 aa  242  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  25.16 
 
 
999 aa  242  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  25.16 
 
 
999 aa  242  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  25.03 
 
 
974 aa  241  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  31.5 
 
 
1028 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  25.36 
 
 
969 aa  238  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  26.14 
 
 
989 aa  238  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>